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Plant CARE 地址：http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/ PLACE 地址：https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?lang=en&pj=640&action=page&pag...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 17:29
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内参基因的筛选

筛选内参基因

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-17 13:18
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blast序列比对中E值是什么意思？

E value——E（Expect）值，表示随机匹配的可能性。E值越大，随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时，具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 10:45
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awk 判断并筛选数据

在linux上利用awk对数据进行筛选，并输出

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-17 09:41
  • 阅读 ( 8343 )

施一公：如何提高英文的科研写作能力

大牛施一公：如何提高英文的科研写作能力

R语言包安装方法，设置国内镜像加快安装速度

R 在线安装包，设置全局镜像，以免镜像不好链接中断  local({r <- getOption("repos")    r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"    options(repos=r)})  或...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-16 21:31
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遗传进化英文方法参考

Library preparation and Illumina sequencing Genomic DNA from each sample was prepared for libraries construction. The library preparations were sequenced by using an Illumina Hi...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-16 21:23
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MCScanX 安装报错，支持64位系统

今天有学员问 MCScanX 安装问题，我试了下，果然有错误。 make报错： g++ struct.cc mcscan.cc read_data.cc out_utils.cc dagchainer.cc msa.cc permutation.cc -o MCScanX msa.cc: In fun...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-16 21:20
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箱线图与分面--ggplot2

利用ggplot2绘制箱线图，并进行分面处理。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-16 12:57
  • 阅读 ( 9206 )

Bioconductor安装软件比较慢

解决Bioconductor安装软件比较慢的问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-16 10:47
  • 阅读 ( 3498 )

微生物PCA分析和PCOA分析差别

PCA pcoa分析取舍

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-15 18:01
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转录组的3种分析模式

转录组分析的3种模式及分析流程

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-13 22:01
  • 阅读 ( 6376 )

热图竟然还能用Excel来画？

利用EXCEl 绘制热图

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-12 21:30
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read.table参数

查看read.table参数

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-12 21:24
  • 阅读 ( 4849 )

MEGAN 分类学树状图 饼图说明

MEGAN分类柱状图解释

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-11 16:06
  • 阅读 ( 4671 )

vi基本替换

利用vi实现文档的搜索替换

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-11 15:52
  • 阅读 ( 2913 )

linux命令如何对两个文件去重复

例如你有两个基因id文件，你想知道这两个文件共有的id，怎末办呢？一行命令就可以解决。cat     文件1  文件1  |sort|uniq    输出的就是这两个文件的并集cat     文件1  文件1  |sort|uniq   ...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 13:54
  • 阅读 ( 2876 )

如何快速获取多条序列长度信息

如何快速知道你的多个序列的长度呢？这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具，samtools。命令行格式：samtools faidx   xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 11:31
  • 阅读 ( 3989 )

如何将基因组的注释文件gff转化成基因的注释文件gtf

在做分析的时候，有时候我们需要将gff文件转化为gtf，如何转化呢？ 这里有一个小工具，虚拟机的bio-linux自带不需要安装，就是gffread： 命令行格式：gffread   gff文件   -T  -o  gtf文件，...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 10:55
  • 阅读 ( 7041 )

分组柱状图--ggplot2

利用ggplot2绘制分组柱状图，并进行标签图例等设置。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-10 17:10
  • 阅读 ( 29518 )