利用aggregate对数据进行分组处理,包括分组求和,分组取均值,最大值,中位数等等
R语言中常见的基本字符串处理,涉及匹配、替换、分割、截取、大小写转换等等
命令行特殊字符处理方法
dCAPS是由CAPS标记衍生的分子标记。它是通过引物引入错配的碱基,从而构建或者去除限制性内切酶识别位点的标记技术
清华大学电子工程学院学生 洪峰
降维排序分析方法包括:PCA、PCOA、CA、DCA、NMDS、RDA、CCA等等还有很多,理解他们的区别与联系才能熟练运用。
教你利用GEOquery并结合Biobase下载GEO数据库多种数据,轻松数据下载与整理。
利用“xlxs"读取真Excel文件中的内容
利用ggplot2绘制密度图,并直接在密度图上叠加另一组数据的密度曲线
利用R 对文件夹下的文件批量读取
WGCNA剔除异常样本
TCGAbiolinks 下载 TCGA 数据
awk擅长于对文件按行操作,每次读取一行,然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...
WGCNA常见问题
命令行筛选差异基因
对于科学问题,我们常常要找到差异,需要用到统计学检验,但是那么多统计学检验我该如何选择呢?
用perl批量处理文件夹下所有文件 opendir()获取目录权柄;readdir()读取目录下文件 #!/usr/bin/perl -w $dirname = "/tmp"; #指定一个目录 opendir ( DIR, $dirname ) || die...
Mean()求平均值 通过求出数据集的和再除以求和数的总量得到平均值 函数mean()用于在R语言中计算平均值。语法 用于计算R中的平均值的基本语法是 - mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...
距离矩阵差别:jaccard bray-curtis 欧式距离 unifrac(weighted/unweigted)
之前在linux系统执行以下命令: ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果,百度之后发现 sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline...