landy
Ka/Ks与进化选择压力
Ka/Ks表示的是非同义替换（Ka）和同义替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 同义/非同义突变概念 同义突变表示氨基酸没有改变，氨基酸没...
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- landy
- 发布于 2018-05-23 16:53
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omicsgene
smyang2018
推荐一个好用文献管理软件：CNKI E-Study——数字化学习与研究平台(1)
CNKI E-Study——数字化学习与研究平台的学习使用
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- smyang2018
- 发布于 2018-05-18 19:22
- 阅读 ( 4534 )
linux常用命令整理之文件解压缩：
linux常用命令整理之文件解压缩：tar命令：解压：tar xvf FileName.tar压缩：tar cvf FileName.tar DirName gz命令解压：gunzip FileName.gz压缩：gzip FileName zip命令解压：unzip File...
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- landy
- 发布于 2018-05-18 13:03
- 阅读 ( 2715 )
microRNA
Python虚拟环境解决不兼容问题
采用Python 虚拟环境，解决python不同版本，不同包 间不相容的问题
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- microRNA
- 发布于 2018-05-18 10:11
- 阅读 ( 3115 )
pip安装python模块
python模块安装还是非常简单的，只要把pip安装好之后，一切都用一条命令搞定。 如果你使用的是从 python.org 下载的Python 2 >=2.7.9 或者Python 3 >=3.4，那么pip是已经安装了。 1....
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 09:47
- 阅读 ( 2619 )
安生水
提取bam/sam文件指定区域reads
若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads，可以使用samtools和bedtools来实现。 首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID，第二三列分别为起始终止位置 ...
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 09:34
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微生物多样性分析之Bray curtis距离
Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的主要基于OTUs的计数统计比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离包含的信息完全不一样相比于jaccard距...
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 09:21
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NCBI检索叶绿体基因并快速下载
叶绿体是绿色植物进行光合作用的细胞器，具有合成蛋白质、淀粉、色素等功能，普遍存在于真核自养生物中，尤其是藻类和陆生植物，其基因组可自主遗传。叶绿体基因组序列对于研究植物物种起源，进化演变及不同物种间的亲缘关系等具有重要意义。
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 08:52
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如何将SNP标记转化成可跑胶验证的CAPS标记
现如今，基于高通量测序得到的SNP信息无疑是海量的，然而SNP标记的验证却并不容易实现。其最好的验证方式是一代sanger测序，不过价格较高，而且通量低。如果SNP刚好位于酶切位点上，就可以将其转化为CAPS标记，利用跑胶的方式对其进行验证，既便宜又好用。
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 08:46
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