植物转录因子调控分析
介绍plantregmap网站的一些分析转录因子的功能
今天介绍一个植物的转录因子调控的综合性分析网站plantregmap，该网站的功能非常的强大，其主要功能包括如下：
1. 植物转录因子预测
输入蛋白序列或者核酸序列即可对是否是转录因子进行预测，如果是转录因子，会对转录因子的结合位点，保守性等有详细的信息
2. 转录因子结合位点预测
选择一种物种，输入转录因子上游的Promoter 序列，即可预测那些转录因子结合于Promoter 那个区域
3. 转录因子富集分析
输入一组基因的名称，即可预测调控这些基因的转录因子，并对转录因子进行功能富集分析，富集显著的转录因子即为最重要的调控因子
4. 调控网络分析
综合前面的两种分析模式，即可进行调控网络的分析。选择一个物种，输入一组基因的promoter序列，就可以对调控这些基因的转录因子进行分析，并可以对转录因子进行富集分析，这就可以筛选出关键作用的转录因子。结果如下：
5. GO 富集分析
针对一组基因进行GO富集分析，分别从分子功能，细胞组份和生物过程3个方面进行功能富集分析。
利用好这个网站，分析转录因子的调控，那就易如反掌了。
如果您对转录因子的调控比较感兴趣的话，可以学习我们的《转录组数据挖掘》课程，里面有专门针对该网站的介绍。
- 发表于 2018-06-29 13:40
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- 分类：转录组
