如何计算基因组中的连锁不平衡

连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一个群体中,不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象,一般用D,D'和r²来表示LD的程度。

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corrplot包绘制相关性图,简单又好看!

相关性分析作为一种强大的工具,能够帮助我们量化变量间的关联程度。

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  • 安生水
  • 发布于 2025-04-16 14:43
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PDF翻译神器:PDFMathTranslate让看英文文献不再成为烦恼

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-04-16 11:26
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空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-04-08 14:31
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使用AI批量统计fastq文件的测序量

我的文件夹下面几十个样本的双端测序数据,需要进行数据量的统计,让AI帮我批量编写代码整理一下

ai助手帮我画环形堆叠柱状图

前两天看文章里面有一个很漂亮的环形堆叠柱状图,但是我懒得查资料,所以我尝试让ai帮我画一下 结果如下,这个是完整 的链接  https://www.cici.com/thread/w0ed44c9006bd080c 还是可以的...

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  • xun
  • 发布于 2025-03-28 11:03
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ai助手帮我构建新的qiime2分类器

在挖掘数据的时候发现有的数据用的是v2版本的,我手里只有全长的和v3-v4的,全长效果没那么好感觉,但是我好久没有看过qii2相关的东西了,有点忘了,刚好最近ai很火,我就尝试用ai帮我构建,过程如下...

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  • xun
  • 发布于 2025-03-28 09:58
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AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机root密码

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  • 安生水
  • 发布于 2025-03-27 15:16
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AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机内存大小

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  • 安生水
  • 发布于 2025-03-27 14:57
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《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

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  • 安生水
  • 发布于 2025-03-17 16:01
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AI 写代码之绘制GWAS 曼哈顿图

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  • 发布于 2025-03-14 19:34
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用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

用AI写代码只批量链接GEO 10X数据:

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-03-14 18:42
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AI助手帮我整理GEO数据库中样本信息表格

AI助手帮我整理GEO数据库中样本信息表格

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-03-14 14:35
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已知集合交集数量绘制韦恩图

大部分R包无法直接根据已知的交集数量绘制 Venn 图,必须依赖提供的集合元素列表进行计算,但是少部分R包可以,比如VennDiagram包

IF=13.80 | 岗巴羊胃肠道微生物群落动态变化及其在植物生物量降解中的功能分析

研究探讨了不同饲养策略对甘巴羊生长性能及肠道微生物群落的影响。通过宏基因组和qPCR分析,发现不同饲养策略显著改变了微生物群落的多样性和组成。同时评估了与植物多糖降解相关的酶基因

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  • xun
  • 发布于 2025-03-04 14:13
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IF=5 | 健康犬的肠道微生物组和代谢组对膳食纤维的反应

2024年12月《mSystems》发表了一篇题为“Response of the gut microbiome and metabolome to dietary fiber in healthy dogs”的文章。

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  • xun
  • 发布于 2025-03-04 14:08
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在R里绘制地图

在R语言中绘制地图是数据可视化的一个重要方面,其提供了多种方法和工具包来绘制地图,包括基于经纬度数据的地图、行政区划图等。今天教大家使用ggmap、maps这两个包,进行地图的绘制。 ggmap...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-03-03 15:13
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在凤蝶属基因组中的基因进化分析和水平基因转运(HGT)模式

“ 2024年11月《Genomics》杂志发表了一篇题为“ Genomic evolution and patterns of horizontal gene transfer in Papilio”的比较基因组文章。文章研究了11个凤蝶物种间的进化关系,分析物种...

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  • rzx
  • 发布于 2025-02-28 16:25
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ROC 曲线绘制,多个和x轴空白

ROC 曲线绘制:

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  • omicsgene
  • 发布于 2025-02-24 20:42
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