20个转录组基本知识点-你必须知道!

做转录组实验,发转录组文章,你不得不知道的20个基本知识点。

转录组测序分析数据库介绍

转录组数据分析常用数据库介绍

R语言对基因表达量数据RNA-seq做PCA分析

PCA(principal component analysis )主成分分析,可以分析样品之间相关性,确定样品总体上的差异,或者查看是否有批次效应等

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-04 15:21
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5分钟看懂KEGG代谢通路图

ko、map等开头的代谢图有啥区别?里面的点、线、不同颜色都代表什么含义?看完这篇就懂啦!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 21:41
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mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配

转录组扫盲系列--reads如何比对到参考基因组上?

上一期给大家介绍了转录组建库原理:转录组扫盲系列--转录组如何建库?建完库下一步就是测序,测序原理讲起来其实很复杂,但是我觉得测序过程少了解一点对于理解转录组数据影响不是很大,下面有...

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  • 红橙子
  • 发布于 2021-04-26 19:13
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转录组结果解读及分析技巧

已经测了转录组,或者计划做转录组,但又担心写不出来文章?一站式解决转录组难题,趁开学前投稿吧!

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  • omics007
  • 发布于 2020-05-18 14:01
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JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

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  • 发布于 2018-07-27 10:14
  • 阅读 ( 18674 )

转录因子研究方法!

转录因子研究方法

WGCNA分析要求

WGCNA常见问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:04
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转录组数据挖掘的几个建议

如何挖掘数据?明确研究目的,实验方案设计,关注已知的结果,结合表型,进行突破

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 11:28
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转录组扫盲篇

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA、非编码RNA以及小RNA等,不过咱们常说的转录组或者RNA-seq,一般是指狭义上的“转...

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  • 红橙子
  • 发布于 2019-03-20 14:34
  • 阅读 ( 5601 )

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-03 10:54
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WGCNA剔除异常样本

WGCNA剔除异常样本

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:53
  • 阅读 ( 5975 )

转录组扫盲系列--转录组如何建库?

很多老师都做过转录组,但你对转录组了解吗?知其然,更要知其所以然,才能对数据结果理解更深入,从本期起,小编给大家详细介绍下转录组实验及分析过程,里面肯定有你不知道的知识,赶紧get下...

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  • 红橙子
  • 发布于 2021-04-26 19:02
  • 阅读 ( 8952 )

转录组测序样品间的相关性有何意义?如何计算?

样品间的相关性反应了样品间的相似程度,即不同处理或组织的样品在表达水平方面的相似度。相关系数越 接近1,样品间的相似度越高,样品间的差异基因也越少。生物学重复间的样品的相关系数...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 14:02
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如何将GEO芯片注释文件整理成GSEA能使用的芯片注释文件?

将GEO数据库中的注释文件整理成GSEA软件可以使用的芯片注释文件

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 15:01
  • 阅读 ( 8103 )

转录组分析基因注释常用的数据库

转录组分析常用数据库

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:42
  • 阅读 ( 9689 )

转录组的3种分析模式

转录组分析的3种模式及分析流程

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-13 22:01
  • 阅读 ( 4364 )

当下,转录组文章怎么写?

以一篇今年发表在《BMC Genomics》上的转录组文章为切入点,探讨18年转录组文章需要怎么写?

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-21 22:44
  • 阅读 ( 5244 )