利用ggplot2绘制箱线图,并进行分面处理。
解决Bioconductor安装软件比较慢的问题
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如何快速知道你的多个序列的长度呢?这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具,samtools。命令行格式:samtools faidx xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件,也是就是在...
Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法: $gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1); 其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的...
金币能干什么
biolinux
biolinux打不开
利用公共数据发文章,基因家族好思路。 虽然我们一直在说可以“用别人的数据,写自己的文章”,但是具体怎么操作,很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。 读前准...
4个甜瓜重测序绘制抗白粉变异图谱[1]发PLoS ONE
混池测序做遗传进化,分析受选择基因
跟着PNAS学微生物多样性分析!
给大家介绍一类代表包含关系的图,那就是韦恩图。
5个转录组也能发4分文章,想要少投入,多产出,既要站在巨人的肩膀上,也得打铁还需自身硬啊!
您有大量的品种资源么?您想发高分文章么?群体进化和GWAS分析助您心想事成!
做方差分析,用Excel,简单、快捷、方便,你值得拥有!
不管是重测序或者是有参转录组,很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说,常用比对软件都可以正常运行结束,但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题,这些问题有的时候...
在一些群体遗传进化的文章中,会展示整合了物种分类和大量系统发育推断(灰色虚线)的进化树,接下来小编将绘图代码贴在下面,效果如下图: 1.准备数据 准备3个文件,其中两个nwk格式的树文件...
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GATK SPARK 环境安装