perl - 推荐的文章 - 组学大讲堂问答社区

提取指定基因的fasta序列

简便好用的序列提取的perl脚本

1
6
安生水
发布于 2018-07-27 09:31
阅读 ( 8084 )

perl对文件夹处理

用perl批量处理文件夹下所有文件 opendir（）获取目录权柄；readdir（）读取目录下文件 #!/usr/bin/perl -w $dirname = "/tmp"; #指定一个目录 opendir ( DIR, $dirname ) || die...

1
4
安生水
发布于 2018-05-24 16:15
阅读 ( 2614 )

Perl 入门之 context 标量上下文与列表上下文

0
3
omicsgene
发布于 2018-12-24 16:47
阅读 ( 2795 )

Perl 子程序(函数)

0
2
omicsgene
发布于 2019-01-14 15:42
阅读 ( 2316 )

GFF中提取所有转录本的位置信息，以及对应的基因ID信息；

提取基因的转录本信息，以及对应的基因ID；

0
2
omicsgene
发布于 2018-12-13 22:33
阅读 ( 8502 )

提取基因组所有基因的启动子序列

有时候们会需要基因的启动子序列，这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。

4
2
安生水
发布于 2018-06-29 12:56
阅读 ( 8652 )

bioperl处理fasta和fastq序列截取反向互补翻译等等

截取，反向互补，读入，写出，筛选等

0
2
omicsgene
发布于 2018-06-08 15:30
阅读 ( 5678 )

Perl去除一个数组中的重复元素

0
2
安生水
发布于 2018-05-09 16:32
阅读 ( 2258 )

perl中判断数组中是否含有某个元素

0
1
omicsgene
发布于 2019-12-30 15:17
阅读 ( 5230 )

从gff文件当中提取对应转录本ID的基因结构信息用于GSDS绘制结构图脚本更新

get_gene_exon_from_gff.pl 脚本更新，

1
1
omicsgene
发布于 2019-03-15 13:34
阅读 ( 6796 )

提取合并基因家族的domain序列

0
1
安生水
发布于 2019-02-15 13:27
阅读 ( 5229 )

Perl 包和模块

0
1
omicsgene
发布于 2019-01-14 16:46
阅读 ( 1822 )

Perl 变量命名规则

perl中变量命名规则

1
1
omicsgene
发布于 2018-12-24 15:00
阅读 ( 4380 )

perl中q,qq,qw的区别

0
1
安生水
发布于 2018-08-31 14:28
阅读 ( 4627 )

从MEGA进化树分析结果nwk文件提取基因ID

从nwk文件中提取基因ID

1
1
安生水
发布于 2018-07-27 14:38
阅读 ( 8372 )

perl 从数组随机抽取元素

perl中如何随机抽取数组中的一个元素。

0
1
安生水
发布于 2018-07-13 13:51
阅读 ( 5540 )

ActivePerl自带的PPM软件无响应

ActivePerl安装perl模块

0
1
omicsgene
发布于 2018-07-09 16:41
阅读 ( 5269 )

perl 中glob函数

perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能，文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。

0
1
安生水
发布于 2018-06-22 14:29
阅读 ( 5726 )

Perl提取染色体序列指定范围的基因序列

Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数，用法： $gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1); 其中$fasta是总的序列；$start是提取序列的开始位置，由于Perl字符串是从0计数的...

1
1
安生水
发布于 2018-05-09 16:27
阅读 ( 3747 )

怎么用Perl脚本得到反向互补序列

0
1
安生水
发布于 2018-05-09 15:51
阅读 ( 3640 )