组装"预实验" | 物种倍性分析

倍性直接影响基因组的大小和复杂性,不同倍性的物种需要不同的组装策略,了解物种的倍性对于基因组组装至关重要

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-11-25 15:22
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annovar的染色体识别问题

如果是非数字形式的染色体编号(尤其是其中有特殊字符),annovar的注释可能会有问题,需要改成数字格式

甲基化水平计算

甲基化水平计算

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-21 14:20
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scanpy 中 ScTransform分析:

scanpy 中 ScTransform分析:

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-20 08:23
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seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

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  • rzx
  • 发布于 2024-11-19 19:01
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R 安装github包报错:

R 安装github包报错:

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-18 15:42
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R公式中如何加入变量

expression()函数是没办法同时代入公式和变量,这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote()

空间转录组数据读取

10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 16:56
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IF=13.8 | 甘油/二醇脱水酶是后肠发酵食肉动物肠道微生物群的关键功能

“ 2024年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Trait-based study predicts glycerol/diol dehydratases as a key function of the gut microbiota of hindgut-fermenting carnivores(Saccha...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-13 10:44
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IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...

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  • 发布于 2024-11-12 18:10
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R语言基础入门—数据结构(2)

R语言基础入门—数据结构(2)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:55
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R语言基础入门—数据结构(1)

R语言基础入门—数据结构(1)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:50
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R语言基础入门—R语言概述与安装!

R语言基础入门—R语言概述与安装!

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 17:43
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eQTL分析之协变量计算

准备eQTL分析的协变量文件

Linux三剑客之grep-文件中的信息捕获

在Linux系统中,grep(Global Regular Expression Print)是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行,并将其打印出来。今天,我们结合以下...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-11-12 17:36
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Upset图绘制

Upset图绘制

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  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 16:27
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exFAT格式的硬盘挂载问题

我们在挂载ntfs格式的硬盘的时候,一般可以正常使用linux命令,不会有啥问题,但是如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改 如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代...

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  • xun
  • 发布于 2024-11-11 17:22
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docker clash 配置

docker clash 配置

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-05 11:55
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安装R包报错 fail to lock directory

这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录,这通常是因为之前的安装进程没有正确完成,导致锁文件(一个隐藏的文件,用于防止同时写入目录)仍然存在。

单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-10-29 09:47
  • 阅读 ( 1875 )