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GSEA法基因功能富集分析原理详解！

在组学大讲堂之前的一篇微信文章：关注的功能基因集在转录组结果中表现如何？中，跟大家介绍了GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）及其分析结果。GSEA是一种基于基因集的富集分析方法，在对...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-25 18:16
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蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

基因家族，理化性质分析

全基因组加倍/复制介绍（whole genome duplication, WGD）

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  • 发布于 2023-03-02 17:24
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常见的植物数据库（更新-Ing）

常见植物基因组数据库

已知目标基因，如何进行局部共线性绘图？

在日常的生信分析中，通过一些组学分析策略我们能够得到与某一物种性状紧密关联的候选基因。在此情况下，如果我们想要对候选基因在其他物种中的同源基因进行查找，或者在染色体上对这些基因进行定位，那么就需要进行物种间基因座的局部共线性可视化(Microsynteny visualization)。今天我们就来教大家使用jcvi软件包中的子程序MCscan(Python version)进行物种间基因组的局部共线性绘图。

泛基因组可视化

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-09-07 15:18
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OrthoFinder 输出结果文件说明

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  • 发布于 2023-03-13 14:12
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最全进化树构建知识点大盘点

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  • 发布于 2023-03-10 15:56
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必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

全基因组直系同源基因簇（Orthologousclusters）的分析是比较基因组学研究中的一项重要内容，直系同源基因簇之间的聚类及网络构建有助于解释跨多物种的蛋白质的功能和进化关系，今天小编给大家...

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  • 发布于 2020-12-05 21:12
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利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

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  • 发布于 2023-02-27 20:46
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基因组重复序列分类 转座子

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  • 发布于 2022-09-06 10:27
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基因组Hic挂载AGP文件格式说明

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  • 发布于 2022-07-20 17:20
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如何利用NCBI提取特定位置的基因组序列？

小编经常遇到这样的一些个性化分析，例如，下载某物种某染色体XXXX-XXXX碱基区域内的全部基因信息，尤其是BSA、QTL定位、GWAS等项目客户，该类需求是很多的；之前给大家分享过一个利用Ensembl数...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-03-17 14:20
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2020年-基因家族分析文章怎么发！

2020年基因家族文章何去何从？还好发么？

混池（BSA）定位必看的10个知识点！

设计混池定位实验必须知道的10个知识点！

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  • omics007
  • 发布于 2019-07-04 12:40
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mcscanX基因组内共线分析输出结果解读

mcscanX基因组能共线性分析结果解读

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  • 发布于 2019-03-19 10:14
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单拷贝直系同源基因构建系统发育树以及分歧时间

跨物种研究物种遗传进化方法

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  • 发布于 2018-06-27 13:06
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对组装结果中GAP左右批量设计引物

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不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较，以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-03-13 15:15
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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-03-13 15:14
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