转录组测序分析数据库介绍

转录组数据分析常用数据库介绍

ANNOVAR人类各个数据库变异注释结果表格说明

ANNOVAR人类各个数据库变异注释结果表格说明,SnpEff

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  • 发布于 2018-09-28 20:06
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qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

实时定量PCR也转录组结合,计算表达量等等;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-20 20:11
  • 阅读 ( 92658 )

一键搞定批量序列提取TBtools!

用基因ID提取其序列很简单,ctrl+F找到ID对应的序列,ctrl+C、ctrl+V就好了,少量基因的还OK,但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽? 这里墙裂推荐一个软件,功能很强大,就是TBtoo...

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  • landy
  • 发布于 2018-04-22 19:08
  • 阅读 ( 27493 )

从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据

用迅雷替代官方的prefetch批量下载SRA测序数据,更快更稳定!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:37
  • 阅读 ( 18778 )

看懂变异记录结果文件(VCF)

做过DNA重测序,群体遗传进化,BSA,GWAS等项目的人都会遇到VCF文件,这个文件记录了全基因组的变异信息,如果不懂VCF文件就无法进行后续分析。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:29
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蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

基因家族,理化性质分析

kaks和dnds是什么?

kaks dnds是什么

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  • omicsgene
  • 发布于 2019-01-30 23:58
  • 阅读 ( 21877 )

投稿时-SCI期刊文章中图片大小如何设置

投稿文章的时候杂志对我们论文当中的图片大小都有要求,关于图片大小的一些概念得明白才能做出符合杂志要求的图片。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-27 14:59
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重磅!2018年最新期刊分区变动(1-4区)+2018影响因子汇总表-生命科学类免费下载

Excel表包含信息有:期刊全名、简写名、(2018及2017年)中科院分区、影响因子、学科分类、SCI/SCIE、投稿难易程度、审稿周期及期刊主页链接;并通过红、绿两种颜色来区分升级和降级期刊,期刊分区变化一目了然!进来下载!

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-06-29 22:09
  • 阅读 ( 19065 )

SNP不能转化成CAPS标记?来试试dCAPS吧!

dCAPS是由CAPS标记衍生的分子标记。它是通过引物引入错配的碱基,从而构建或者去除限制性内切酶识别位点的标记技术

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-30 13:41
  • 阅读 ( 16546 )

R语言包安装方法,设置国内镜像加快安装速度

R 在线安装包,设置全局镜像,以免镜像不好链接中断  local({r <- getOption("repos")    r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"    options(repos=r)})  或...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-16 21:31
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phytozome植物基因组下载网站

今天主要介绍一下Phytozome网站基因组如何下载,通过blast查询多个物种中得同源基因,以及根据基因相关功能结构域等批量下载相关基因的CDS,PEP等序列信息;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:21
  • 阅读 ( 35655 )

ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-05-23 20:44
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感兴趣的蛋白,如何研究它的结构-Phyre2工具使用介绍

筛选出的蛋白怎么去进一步研究它呢?很多人还只停留在定量水平,蛋白质表达量肯定是一个值得考虑探究的因素,但是蛋白质的空间结构与其功能更是相关;蛋白质结构预测你会吗?今天给你分享一款很...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-12-05 21:50
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同源基因概念(直系同源 vs旁系同源 )

分子进化与系统发生同源基因

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  • 发布于 2020-09-28 16:37
  • 阅读 ( 17998 )

pfam数据库介绍及使用

pfam数据库介绍及使用

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  • 发布于 2019-06-18 11:33
  • 阅读 ( 54042 )

多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

蛋白质分析,经常要分析蛋白质的保守结构域,通常要展示多序列比对结果才能说明不同序列间的保守性;看到别人分析的蛋白保守结构域都有一个漂亮的多序列比对结果;今天我们就来介绍绘制这种氨基酸比对图:

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-19 10:07
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提取指定基因的fasta序列

简便好用的序列提取的perl脚本

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-27 09:31
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利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
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