ggplot 柱状图，y轴从0 开始，最高柱子 留有余地代码：
ggplot 柱状图，y轴从0 开始，最高柱子 留有余地代码：
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- omicsgene
- 发布于 2023-06-08 17:34
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omicsgene
NCBI的SRA Lite和SRA Normalized数据有什么区别
有时候我们从NCBI下载SRA文件时会发现，会有SRA Lite和SRA Normalized两种类型的数据，前者后缀是.sralite，其文件大小也比原始的SRA文件要小。这两种数据的区别是什么呢？
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- 星莓
- 发布于 2023-06-08 14:29
- 阅读 ( 7876 )
星莓
安生水
2023年秋季线下/直播培训火热报名中！
疫情已经结束，暌违已久的组学大讲堂线下培训回归了！这个暑期，组学大讲堂为大家准备了丰富多样的培训课程。
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- 生信老顽童
- 发布于 2023-06-08 10:03
- 阅读 ( 4217 )
生信老顽童
csvtk，A powerful software for handling CSV files
CSVTK，即CSV工具包，是一个用于处理逗号分隔值（CSV）文件的实用命令行程序。由于其简单性、灵活性和效率，对于经常处理CSV文件的人来说，特别是在数据科学、生物信息学以及任何需要数据分析的...
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- xun
- 发布于 2023-06-08 09:54
- 阅读 ( 1590 )
xun
解决umount: /home: device is busy
umount -l /home 强行解除挂载
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- omicsgene
- 发布于 2023-06-07 14:08
- 阅读 ( 1722 )
运行命令makeblastdb建库时报错，生成pdb-lock 空文件。
运行命令makeblastdb -in all.pep.fa -dbtype prot -title all.pep.fa 时卡住报错，生成all.pep.fa.pdb-lock 空文件。 解决：makeblastdb 工具版本问题，从2.13.0版本改成2.6.0版本，就可以...
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- rzx
- 发布于 2023-06-05 15:20
- 阅读 ( 1694 )
rzx
kraken2生成的biom文件处理
使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候，如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题，结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果，比如下面这样 可以用脚本来处理，删...
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- xun
- 发布于 2023-05-31 17:33
- 阅读 ( 1847 )
多分组venn图绘制脚本
绘制多分组venn图时发现好多包都不支持，只能用原始的包，脚本如下 #!/share/work/biosoft/R/latest/bin/Rscriptargs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)library(venn)library(VennDiagra...
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- xun
- 发布于 2023-05-30 18:05
- 阅读 ( 1620 )
blastn使用教程及结果详解
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 是我们常用的短序列比对工具，直接输入fasta格式的序列文件就可进行比对
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- 星莓
- 发布于 2023-05-29 14:49
- 阅读 ( 6696 )
dell R430启动失败 NVRAM_CLR jumper
dell R430启动失败 NVRAM_CLR jumper
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- omicsgene
- 发布于 2023-05-27 12:33
- 阅读 ( 1388 )
空间代谢组学|质谱成像技术原理解读
空间代谢组学（Spatial Metabolomics）是整合质谱成像（Mass Spectrometry Imaging，MSI）和代谢组学（Metabolomics）技术，对动/植物组织中代谢物的种类、含量和空间分布进行精准测定的技术，...
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- rzx
- 发布于 2023-05-19 15:48
- 阅读 ( 3954 )
python2运行lefse软件的时候报错
使用python2运行lefse软件的时候报错这是因为当前LEfSe依赖的R包rpy2的版本与你的R版本不兼容，你可以尝试更新一个rpy2的小版本，比如我更新了 pip2 install rpy2==2.8.6 随后就可以直接使用...
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- xun
- 发布于 2023-05-12 18:06
- 阅读 ( 1014 )
综合转录组学和代谢组学分析揭示了菜豆响应冷胁迫的关键调控网络
文章链接：https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-023-04094-1 一、实验样本准备 实验物种：冷敏感菜豆品种093和抗冷菜豆品种120材料处理：将所有菜豆种子在25° 日...
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- rzx
- 发布于 2023-05-12 16:05
- 阅读 ( 1482 )
