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Linux下载数据

1. 查看Linux是否已安装linuxnd软件 下载及安装linuxnd软件：http://data-deliver.novogene.com/download 2. 登录 $/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd login -u 用户名 -p 密码 3. 查...

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  • rzx
  • 发布于 2023-04-10 11:45
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统计每个窗口内SNP变异位点数量

统计每个窗口内SNP变异位点数量

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  • 安生水
  • 发布于 2023-04-07 16:20
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gff文件格式不标准的修改脚本

gff文件第三列一般有gene，mRNA，CDS，exon等等信息，但是有时候我们下载的gff文件没有gene信息，只有mRNA等等的信息，我们可以实用脚本手动校正。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-04-07 16:02
  • 阅读 ( 3195 )

解决Rstudio Server卡顿问题

在使用Rstudio Server出现卡顿，或者每次打开server都会加载之前的工作。 解决方法： 1. 清除工作区内项目信息 2. 在Termianal页面下删除session rm -rf ~/.local/share/rstudio/sessions...

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  • rzx
  • 发布于 2023-04-07 15:39
  • 阅读 ( 3242 )

二叉树算法介绍

二叉树是一种非常重要的数据结构，它在计算机科学和软件工程中有着广泛的应用。本文将对二叉树进行简要介绍，并给出几个实际应用的例子。 一、二叉树简介 二叉树是一种树形数据结构，其中每个...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-07 13:33
  • 阅读 ( 1278 )

gbff 格式注释文件转换成gff3注释文件格式

gbff 格式注释文件转换成gff3注释文件格式

conda一直卡在Solving environment

在使用conda安装CARD数据库自带软件rgi的时候，发现一直卡在Solving environment这一步，查了不少攻略也没能解决问题， 结果换了mamba后瞬间就安装上了，安装非常方便 conda install mamba -c...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-06 16:37
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stack的利用

Python中可以使用栈（stack）数据结构来分析数据。下面是一个使用栈来判断一个字符串中的括号是否匹配的例子： 在这个例子中，我们首先定义了一个空的栈（stack），然后遍历字符串中的每一个...

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  • 发布于 2023-04-06 15:59
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解决基因组当中蛋白质序列ID和gff中ID不一致的问题

解决基因组当中蛋白质序列ID和gff中ID不一致的问题

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-04-06 09:38
  • 阅读 ( 5313 )

linux使用ossutil下载阿里云数据

linux使用ossutil下载阿里云数据

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-31 16:30
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pophelper包安装

pophelper包安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-30 10:10
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wgd syn 报错 KeyError: 6.0

KeyError: 6.0

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-29 19:19
  • 阅读 ( 1461 )

VI、VIM用什么命令跳到文件头和文件尾

VI、VIM用什么命令跳到文件头和文件尾

dQTL.seq方法研究基因定位

dQTG.seq方法包含dQTG.seq1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目，通过观测的标记等位基因数目和...

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  • rzx
  • 发布于 2023-03-29 11:56
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R语言数据整理——tidyr包

tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivot table)的功能 tidyr包主要涉及： 1)长宽数据转换；2)列分割与列合并；3)缺失值的简单补齐

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-24 15:57
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怎样画多物种基因家族共线性分析图？

基因家族共线性分析，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

Linux单行命令

对文本文件做集合交、并、差运算时可以使用sort和uniq awk常用命令 awk '{ sum += $2 } END { print sum }' myfile        #这个命令将计算myfile文件的第二列的总和并打印出来。awk '{ p...

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  • xun
  • 发布于 2023-03-22 13:13
  • 阅读 ( 1065 )

基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-21 18:03
  • 阅读 ( 1701 )

Docker 使用容器来创建更新镜像

Docker 使用容器来创建镜像

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-20 20:51
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【Linux】查看文件中的某几行（中间几行）

【Linux】查看文件中的某几行（中间几行）