基因组重测序docker镜像更新到2.0

基因组重测序docker镜像更新到2.0

基因组重测序docker镜像已经更新2.0:

1.主要是一些软件升级到最新如:fastp,samtools,bwa,GATK ,一些R包等

2.GATK 更新到4.4.0.0,更新群体大规模Call SNP方法;

3.更新大样本量,并行运行讲解

4.其他代码优化等

使用方法:


docker pull omicsclass/reseq:v2.0
docker run -it -v ~/reseq:/work omicsclass/reseq:v2.0


如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像,老用户重新下载示例数据压缩包

 

课程链接:https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ 

  • 发表于 2023-10-16 10:12
  • 阅读 ( 898 )
  • 分类:重测序

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