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老师我200个样本的重测序测完以后，构建进化树时进化树的分群信息和我样本的来源信息不同，该怎么解决呀

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基因家族分析，最长转录本，复制的命令，还是报错。咋整

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请问，gff文件打开后没有biotype,就不用运行保留蛋白编码基因那个命令了吗？

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pav分析，在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢？我是通过课程输入代码来的，写文章怎么写呢？

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老师您好，我在运行collapse_samples.py这段代码用于物种注释时出错，出错信息为 qiime.parse.QiimeParseError: No header line was found in mapping file.请问该如何解决？

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有两个基因不在染色体上在contig上，为什么会这样，图片里的contig可以删掉吗，会有什么影响吗

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单细胞测序FindAllmarkers

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加载本地镜像，中断之后再也加载不起，咋整？

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保留蛋白编码基因运行就这样，不能回到docker ，怎么解决？

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请问pfam 模型下载选择那个是？ hmm后缀的文件还是seed 文件？

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fastsimcoal

  • lint 2025-03-21 10:37
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15 CCS报错---unsupported sequencing chemistry combination

  • K.K. 2025-03-20 22:00
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进不去docker，镜像，虚拟机。

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基因家族结构分析，为什么会出现下图图形盖住基因名的情况，怎样可以改正呢

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老师您好，我在运行这段代码时没有任何反应，请问是出现了什么问题？Oryza文件里是水稻的参考基因组

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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15
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执行ALLHiC分组不成功

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3 二次搜索时提示新建立的domain_new.hmm没有TC阈值

  • 2025-03-15 15:54
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eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

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在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误，