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我的基因家族有两个结构域，应该怎么操作同时提取两个结构域？

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利用hmmsearch检索出来的蛋白序列太少

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进行基因家族共线性分析的时候，拟南芥的可以提取到蛋白序列，但是另外物种在提取蛋白的的时候，pep.fa文件是空的？最后一节课的解决CDS文件提取不成功的方法不适用此问题

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您好，我跟着咱们的一篇文章进行操作，在第四步始终找不到文件，应该怎么操作呀，是关于faprotax这个程序，无法继续进行下去，请老师指点

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跟着文章用docker运行代码进入虚拟机提示：我在将Windows文件提交到wls中，而且一直找不到omicsclass/ampliseq-q1：latest locally

  • 2021-02-05 20:50
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关于微生物群落功能注释-FAPROTAX数据库介绍及使用

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No such file or directory at script/get_fa_by_id.pl line 23.老师，请问这个脚本的问题有什么办法解决。前几个脚本都没问题。我把脚本换了个文件还是不行。

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虚拟机之前一直正常，刚刚卡了，关机后再打开就是这个样子，请问如何解决

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老师好，我想问一下为什么这两个步骤结果对不上，第一个结果里面没有cds的信息。基因文件是在ncbi上下的，步骤也都是按照视频来的。第一次弄不太懂

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各位老师好，我想问一下为什么这两个步骤结果对不上，第一个结果里面没有cds的信息。而第二个都是cds的序列。基因文件是在ncbi上下的

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我在做MCScanX做共线性分析的时候，提取蛋白的文件，出现下面的错误，说是脚本的13行有误，请问怎么修改

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因为现在安装的blast+的版本太高，所以里面没有blastall这个，那基因家族分析中共线性分析的下面这个用到的命令，怎么修改成blastp或者blastn的脚本方式

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请问老师，GEO数据分析时，运行gset = getGEO(GSE, GSEMatrix =TRUE, AnnotGPL=FALSE,destdir=workdir)时，遇到如图中报错，该如何处理呢？

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请问老师，GEO数据分析时，GPL平台没有Annotation SOFT table文件下载，该怎么处理平台注释文件呢？

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麻烦老师请问为啥会出现这种报错？

  • 2021-02-04 16:00
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vcf合并

  • Iron 2021-02-02 15:21
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请问您使用heatmapper时有遇到第六列缺失的情况吗

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5 想请教各位老师在串联重复分析时有碰到类似的情况吗？初次接触不知道该如何调整是好。

  • 2021-02-01 13:31
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请问老师有Mcscan分析时用到的get_gene_position.pl文件吗

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5 求蛋白家族的进化聚类分析详细方案

  • 2021-02-01 00:03