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老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件，这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个

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10 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

  • YYJ 2024-12-30 20:45
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20 群体遗传构建进化树格式转换报错

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ggtree.r进化树问题

  • BJFU 2024-12-30 08:43
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群体遗传分析数据过滤

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老师您好，使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊，是后台有参考数据库吗？

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老师们好，在生成gvcf文件合并vcf文件时，出现这种警告信息，请问是什么原因，如何处理啊？

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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怎么从全部的300份重测序数据的vcf.gz文件中抽出自己的想要的200份数据

  • Max 2024-12-19 17:16
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sed -i 'ls/Marker/chr\tpos/' glm_pvale.txt sed: -e 表达式 #1, 字符 2: 命令后含有多余的字符↵

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重测序

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重测序

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重测问题

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老师，我在分析PSMC时，出现无法查找到染色体名称，fa文件里面的命名是这个样子的，该怎么办啊

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重测序遗传变异过滤

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genome

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cnvpytor

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cnvpytor 不运行

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老师您好，下载镜像失败显示这个该怎么解决？

  • BJFU 2024-11-26 16:44
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重测序文件中的data data 文件打不开