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GATK硬标记过滤速度慢

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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10 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误

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用GATK call 变异的时候，分染色体还是很慢，能不能增加线程或别的改进的方法。

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3 map bwa出错

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利用GATK 分染色体call 变异时出现错误

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docker search没有reseq镜像

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GATK CALL 变异后导入GenomicsDBImport 出现问题

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参考基因组建立索引报错，这是什么原因？

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reseqv2.0镜像annovar报错

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t2t基因组，转录组数据注释

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对原始序列进行去接头，删除低质量的reads

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用GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件

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老师，我在做dadi分析的时候，发现没有代码里显示的easySFS.py的脚本，给的文件里也没有，就一直报错

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GATK 将VCF文件导入db出现问题

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老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时主脚本通过 SLURM 调度系统提交作业，使用 GNU Parallel 并行处理多个样本并调用 HaplotypeCaller 脚本，目前运行了约六七个小时，我的工作日志.err和.out都为空这是正常的吗？

  • Geő 2025-05-14 17:06
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juice box调整hic挂载数据

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GATK 分染色体CALL变异之后怎样合并

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老师，您好！请问做全基因组选择（GS选择）之前，训练集和预测集的划分，有没有代码可以按照特定比例，随机快速实现材料的划分，并生成文件？（比如20%个体作为训练集，80%个体作为预测集；40%个体作为训练集，60%个体作为预测集；60%个体作为训练集，40%个体作为预测集；80%个体作为训练集，20%个体作为预测集，等等）

  • 2025-08-08 16:14
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用R可视化snp分布的时候出现错误：WARNING: ignoring environment value of R_HOME Fatal error: cannot create 'R_TempDir'