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t2t基因组，转录组数据注释

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用GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件

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juice box调整hic挂载数据

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PSMC分析

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VCF文件按照指定的染色体排序

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tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

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#保留蛋白编码基因

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让公司给构建好的图形泛基因组，只有vcf格式文件，要拿它作为参考去基于二代重测序的数据call snp,需要将vcf 文件转化成啥格式呢？转化后用什么软件去call snp 呢？

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重测序var_density.R脚本报错

  • BJFU 2025-12-05 16:42
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重测序过滤

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重测序var_density.R脚本报错

  • BJFU 2025-12-05 16:39
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老师，我想把镜像复制到自己服务器上使用，使用的是singularity run reseq.sif，为何进入容器以后软件都用不了呢，是哪里出了问题？

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基于图形泛基因组文件call取sv的时候，运行命令nohup vg call new_index.giraffe.gbz -r new_index.snarls -k D23.pack -a -A -t 30 -s D23 > D23.vcf 2>call.o &，显示done，但生成的vcf文件里面没有变异位点，只有个头，如截图中所示。这种问题怎么解决呢？

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plink做pca报错

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老师，您好！在变异结果注释ANNOVAR这部分里面，结果出现报错。如何解决？

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PSMC作图为一条直线

  • BJFU 2026-02-28 19:45
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重测序额质控

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hic数据和rnaseq数据是否可以进行snpcalling并进行群体分析