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gwas分析tassel软件GUI界面PCA文件,表型,和hapmap文件合不起来
GWAS
李念
5天前
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重测序cnv变异需要至少多少乘数据?
Iron
2024-03-13 21:47
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有40个样本的基因型(重测序结果)、表型数据。可以做什么分析?
周游
2024-03-01 11:38
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533个品种先根据盐浓度下发芽率,初步在盐胁迫下挑选120个具有不同发芽时间的品种(不发芽的品种忽略,会导致出现重复表型),然后进一步进行详细表型分析(增加测量性状,如根长、芽长、光谱性状),然后做GWAS关联。
GWAS样本选择
周游
2024-03-01 09:57
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如果是基于已知的两个遗传位点,用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪,处于这样的目的40个品种够吗,出于这样的目的的话对品种数量有要求吗?
GWAS样本选择
周游
2024-03-01 09:56
0
回答
275
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mutmap
《心向阳光&
2024-01-08 14:44
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获取选择区域的基因
shidandan
2024-01-03 22:17
0
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ANNOVAR变异注释报错:Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)
变异注释
薄信
2023-12-22 19:38
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368
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GATK过滤掉三分之一的位点正常吗
GATK4
231
2023-12-14 12:49
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571
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用linux系统做gwas时运行脚本报错[Thread-9] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - 0
GWAS
不会三分
2023-11-30 17:23
0
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262
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请问如何计算总体的pi值?
shidandan
2023-11-16 16:26
0
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314
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建立注释库
shidandan
2023-10-29 17:58
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基因组重测序,变异结果注释的时候出现了Error: invalid record found in annovar outputfile
重测序
2023-10-18 14:48
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434
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老师您好,请问一下GWAS筛选植物NPK高效因子前需要做什么准备工作
GWAS
是但
2023-10-17 10:46
0
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老师,您好!我在用-SortGenotypeFilePlugin排序vcf文件时,得出来的文件比原始文件小很多。
QCJ
2023-08-08 16:56
0
回答
881
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如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因?
重测序
GWAS
linliw
2023-07-27 16:13
0
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662
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请问三倍体重测序数据可否用于2n配子形成机制的研究
重测序
2023-05-31 11:03
0
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老师您好,我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析,已经组装好线粒体基因组,是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么?
群体遗传
叶雪儿
2023-05-10 17:57
0
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samtools过滤多重比对的-F 256参数设置
zhu shuliang
2023-04-17 17:49
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用Tassel转vcf为hapmap格式文件
哄哄
2023-04-09 22:51
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