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用EDTA流程进行植物基因组重复序列注释是否可行？

  • sen 2023-01-03 10:14
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10 基因组survey时K值的选择

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基因组染色体共线性分析出现 Unable to run 'false OUTFig.gp', Inappropriate ioctl for device

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PASA组装转录本时候报错，既不能创建也不能删除数据库

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使用qiime2导入数据时，一直报错，不知怎么解决。万分感激！！

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成功启用镜像后，目录下的文件可以查看到，大小也是正确的，但是total显示为0，如何解决这个问题？

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PSMC分析得到的psmc.fa文件总为空

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有什么疾病是遗传的？？

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请问怎么统计一个基因组的Copia和Gypsy

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如何筛选两个种群（亚种）的保守差异基因？

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10 合并gvcf的问题

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10 如何安装和使用LTRharvest？

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老师，tbtools更新到最新版本（1.098761），下载安装包以后，安装进度条到一半的时候就关闭了，没有任何提示，这该怎么解决呢

  • Burn 2022-07-14 15:46
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老师，我在做基因家族相关分析时，发现NCBI已上传的基因组注释不全，不规范，其它网站也没有收录，基因家族分析能不能通过转录组数据（无参有参数据都有）来分析

  • Burn 2022-06-24 19:03
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老师，我用IDlist文件提取基因组里对应exon，mRNA等，发现提取文件为空，然后我发现基因组注释文件里的ID都是这样的，这该怎么处理

  • Burn 2022-06-21 10:04
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物种间的共线性分析

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indel引物设计

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通过blast比对来确定基因家族

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10 请问一下怎么将几个物种叶绿体基因组进行多态性比对从而得到多态性位点？

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5 老师好！我分别用课程里fst, pi, TajimaD 方法筛选出的top5%基因，都是只有第一条染色体上的（我的数据一共有16条染色体），出的图也都只是第一条染色体的。但是用fst和pi联合筛选的基因，16条染色体上的都有。为什么会出现这种情况呢？