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RSEM定量的问题

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基因数目较少，做wgcna是否有意义?

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5 安装gdc client 时出现问题，打开提示。。。too few arguements 闪退

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5 TCGA生存分析报错

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关于genecode的ID提取

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5 TCGA-基因差异表达分析课程中您写的perl脚本如何运行？

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5 老师，您好。我初次接触网络图。目前遇到一些问题还望得到您的帮助。在R中生成gml文件时先运行pattern<-co_occurrence_network(Abu,0.6,0.01)。但出现了Error in V<-(*tmp*, value = *vtmp*) : invalid indexing的错误，我查过一些资料不过没太搞懂。下面是我用到的表格，应该是表格的问题，但对比例表并没有差异。

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WGCNA分析剪切高度怎么来确定？

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5 atacseq测的是RNA还是DNA，和chipseq有什么区别呢？

  • 2018-09-14 22:16
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有GO号，用amigo搜索GO注释，能具体点吗？

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5 老师您好：关于TCGA的生存分析，用训练集train来做单因素的生存分析筛选有意义的基因，为什么在鲁棒性分析的时候不用训练集，而是整个数据集exprSet呢？

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无参物种做三代全长转录组需要注意什么？

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如何检测鉴定植物内病毒？

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筛选不到串联重复基因

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请问，有些文献中，给出的KME值，在WGCNA教程中，生成的"10_GS_and_MM.xls"文件中，哪个和它是对应的？比如下图所示。文献链接如下：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5429000/

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5 老师，您好！我找不到MEME分析perl脚本，请求帮助！

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5 三代无参全长转录组做基因家族进化树分析时发现有多条序列的蛋白序列相同，有必要删除相同序列吗？

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5 请问一下，当用时期作为表型数据时，文件该是什么格式？行和列各怎么赋值，还有就是重复间要不要区分？

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相同材料不同处理之间，可相同材料不同处理之间，可以放在一起做WGCNA分析吗？比如重金属和盐碱处理。

  • 2018-09-13 11:36
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老师好，请问怎么找一个家族基因隐马尔科夫模型的pfam索取号