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我想咨询一下wgcna问题

  • Iok 2023-06-30 15:52
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mcmctree报错物种数太多

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您好，怎么在二代测序基因组提交后，上传同一株细菌的三代测序基因组结果啊？怎么去处理啊？

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蛋白序列中的点，在跑orthofinder的时候报错

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批量srr转fastq

  • lizi 2023-06-20 11:15
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BWA比对报错

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蛋白三维结构预测swiss-model中搜索模型的时候，搜索到模版相似性最高的是算法得到，相对低的那个是试验证实的，应该选哪个构建模型

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请问一下mcmctree运行的结果中为啥没有出现替换率呢

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您好，我做全长转录组，我安装的软件isoseq3没有polish这个功能？请问我要安装isoseq3的哪个版本？

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请问三倍体重测序数据可否用于2n配子形成机制的研究

  • 2023-05-31 11:03
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按着课程做，用的也是组学的数据，KEGG富集分析，只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

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用MCScan做共线性分析时，准备allmRNAID.txt文件，发现有些转录本定位在了contig上，这些定位在contig上的转录本需要算进去吗？

  • 2023-05-24 00:55
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10 按着课程做，用的也是组学的数据，KEGG富集分析，只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

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请问导入数据时总是出现：“no such command”是什么原因啊

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paircoil2使用报错

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有log2FoldChange的值怎么画热图

  • 2023-05-13 11:45
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老师您好，我在注释基因组重复序列时，使用repeatmasker、repeatmodeler、repeatproteinmas、trf注释完后，使用代码整合时出现重复序列比例大于100%，代码没有什么问题，请问还可能是什么原因导致的呢？

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做MCScanX共线性分析提取不了蛋白序列文件

  • 2023-05-12 10:39
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老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

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老师，我现在肠道菌群送检的数据有两个批次，用的引物序列不一样，在去除引物的操作中是分为两组去除吗，还是在一起去除两次，去除后如何合并两组处理后的数据