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先进行基因型填充还是先SNP过滤

  • 231 2023-09-11 11:13
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老师您好，我在看您的视频学习docker的时候，转录组比对的时候，结果空的，后续工作该怎么办呀

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10 老师您好，跟着讲解计算转录组power时，提示文件太大，怎么办

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您好，请问这个data_list里面的genenames（head(meanFpkm) meanFpkm=as.data.frame(meanFpkm) data_list=list(A=geneNames[meanFpkm$A>0.5],A1=geneNames[meanFpkm$A1>0.5],A2=geneNames[meanFpkm$A2>0.5],A3=geneNames[meanFpkm$A3>0.5])是需要自己匹配得出来吗？

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为何输入fpkm值会出现图标的数值，这中间是如何换算的。

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10 代谢物分子注释结果的筛选

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mRNAid_to_geneid.pl这个文件是所有基因共用的，还是不同基因这个文件也不同

  • 李 2023-08-22 10:57
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mRNAid_to_geneid.pl这个文件是所有基因共用的，还是不同基因这个文件也不同

  • 李 2023-08-21 20:21
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是不是木薯的叶绿体DNA在ncbi上只有这两条啊Ĉ 然后我按课程步骤走发现这两个还是一样？

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请问老师，用多个物种的转录组pep数据可以进行比较组学中基因家族聚类、扩张收缩等的分析么？

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R运行代码出现报错

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老师，您好！我在用-SortGenotypeFilePlugin排序vcf文件时，得出来的文件比原始文件小很多。

  • QCJ 2023-08-08 16:56
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老师 你好 我想问一下以log2FC为纵坐标的定量结果的统计图怎么做 网页上的没看太明白

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做物种间共线性分析时报错，这是因为什么

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老师，我看您之前分享过一个HGMD数据库的下载链接，但是现在似乎失效了，请问能再次分享一下吗？

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iqtree 分析需要ASC矫正嘛？

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基因芯片探针与基因ID转化

  • ZLX 2023-07-29 16:31
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利用代码绘制共表达网络时，有一个聚类最多的基因颜色模块没有导入Cytoscape的两个文件，谢谢老师

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如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因？

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您好，关于随机森林那篇博文中的数据能够分享吗？