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gatk VariantFiltration这一步的过滤，我看到gatk 官网上SNP和indel的过滤条件有点不一样。是否可以把SNP和indel从all.raw.vcf.gz提取出来个各自硬过滤后再合并做后面的分析？

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老师我想问一下，基因家族鉴定出来的结果里有一些基因是假基因，做后续分析的时候要不要把它们删除呢

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用于动物基因家族成员的顺式作用元件分析的数据库

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SCI引用文章数据CC BY 4.0问题

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5 如何制作PubMed过滤器

  • 2023-12-04 10:11
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用linux系统做gwas时运行脚本报错[Thread-9] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - 0

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基因家族中，不含有保守序列的基因要删除吗？

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基因家族中，不含有保守序列的基因要删除吗？

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本地blast出现问题

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10 老师您好，我在用共享服务器做qiime2物种注释的时候，putty与服务器的连接会中断，试了好几次都不行，filezilla里面也没有找到运行结果，请问一下这是什么原因呢？

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docker 启动报错&容器中进程终止

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您好老师，绘制circos图，出来的共线性共4条但是两个两个重贴这种情况怎么办。

  • Lynn 2023-11-21 21:41
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可以利用重测序的结果做表型预测模型吗?(模型构建数据仅基于重测序结果做)

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请问这是什么问题

  • 李 2023-11-20 10:10
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请问这种现象和我在另一台电脑上登录docker进行分析，然后没有把他退出留在后台有关吗

  • 李 2023-11-20 07:39
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请问如何计算总体的pi值？

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为什么做完这部分基因就剩一个了

  • 李 2023-11-16 09:07
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请问如果我先对蓖麻，拟南芥等的CDPK基因家族做了blast分析，找出了蓖麻中的CDPK基因，还用进行那些hmmer分析什么的吗

  • 李 2023-11-15 01:44
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5 我手里有老师给的700＋水稻品种，这700＋品种重测序结果直接从水稻3K里down下来的，请问可以用来做遗传群体进化分析吗？

  • 2023-11-14 15:42
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老师我想请问比较基因组的问题，我做出来了基因家族扩展收缩的问题，根据课程学习内容，我能提炼出我要研究物种的基因了，但是遇到了一个问题是，假如我想提取一类，比如头足类，该怎么把头足类的所有基因扩展收缩提出来。