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基因组注释问题

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MEME网站下载的motif图片中基因不全，只有网页中显示出来的基因。

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请问大家我从bioproject下载的sralite文件，转为fastq格式后内容有问号

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请问老师mapchart做蜈蚣图基因id字体怎么调

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5 在进行注释过程04.PASA_assembly出现错误

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FPKM值＞1可作为筛选数据的标准吗？

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基因注释

  • Jay 2024-03-24 21:55
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请问nextpolish运行报错，run.cfg文件和报错信息如图，麻烦老师看下，谢谢！

  • 荣 2024-03-19 16:54
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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 16:27
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在基因家族分析时，保留编码蛋白基因命令时出现 bash :agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl : command not found

  • Lu 2024-03-18 15:52
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LDBlock绘制局部曼哈顿图的时候，我想加入目标区段多个环境SNP检测到的P值，请问数据格式是什么谢谢

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老师，我分析的物种是6倍体，参数需要变动嘛？

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老师，我不知道 circos片段重复基因共线性分析图哪里出错了，画不出来

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重测序cnv变异需要至少多少乘数据？

  • Iron 2024-03-13 21:47
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nextpolish报错

  • 荣 2024-03-06 23:19
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R语言“had non-zero exit status”安装报错

  • 2024-03-05 10:28
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有40个样本的基因型（重测序结果）、表型数据。可以做什么分析？

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30 533个品种先根据盐浓度下发芽率，初步在盐胁迫下挑选120个具有不同发芽时间的品种（不发芽的品种忽略，会导致出现重复表型），然后进一步进行详细表型分析（增加测量性状，如根长、芽长、光谱性状），然后做GWAS关联。

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如果是基于已知的两个遗传位点，用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪，处于这样的目的40个品种够吗，出于这样的目的的话对品种数量有要求吗？

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survey图