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对宏基因组的分类和功能数据去除低丰度数据时，论文中经常采用0.1%,0.01%或者不说明，我可以采用其他取值不在文中说明吗

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linux终端如何打开一个应用的GUI

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老师，我正在做泛基因家族分析中结构变异与基因结构和保守结构域分析，

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蛋白互作分析，Orthovenn3选择内容太多，不知道选啥？

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对原始序列进行去接头，删除低质量的reads

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进化树+motif+基因结构三个一起显示报错

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泛基因家族分析

2 解决

基因ID

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蛋白互作，该下载哪一个结果txt文件。

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共线性分析，最后一步出不来pdf。看不懂提示。

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老师请问，怎么把这些文件像您一样做成一个文件在数据库里确认结构域

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基因家族分析

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请问老师，我已经成功在docker挂载我自己的基因组文件了，和01dataprepare前几个步骤一模一样，但是最后链接到01dataprepare的文件还是红色的无法打开

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课程里使用bracken对kraken结果进行修饰我发现全部都注释到种水平了这个是bracken算法的设置原因吗？

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老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

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共线性分析出现如下报错，但是还是有结果。而且也能出图。这是怎么回事呢

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我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

  • jpq 2025-05-26 15:37
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不同物种之间的共线性分析，出现问题，望解答、谢谢

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tgsgapcloser报错

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老师，我每次做“提取可靠基因家族成员的结构域序列”，提取出来的基因就变成了一个，之前正常的例如WRKYgene.pep.fa也相应变为一个了，请问老师，是我WRKYgene.list文件有问题么？但是生成pep是正常的