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老师，您好！全基因组选择，利用自己的SNP数据（芯片SNP）进行基因型数据处理，beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后，得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。

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fastp过滤宏基因组序列

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有参转录组数据分析，样品和基因组比对效率只有零点几，这是为什么？

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老师，就是我组装叶绿体基因组，组装出来怎么是这个鬼样子啊，而且只有embplant_pt.K105.scaffolds.graph1.1.path_sequence.fasta，没有1.2， 这是什么问题呀

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GATK 分染色体CALL变异之后怎样合并

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老师您好，我在搭建t2t基因组时候，hic挂载时，使用bwa aln和sampe比对时说版本不一致无法使用，查找原因说是因为大于100bp，现在使用bwa mem比对后就格式不一样，使用课程里的allhic的PreprocessSAM.pl和filterBAM_forHic.pl就无法使用了，格式不对，修改脚本后过滤出9.8g的bam文件，使用ALLHic_partition进行分组设置k=15，但是分组运行后只能分出1组，该怎么办呢？这是什么原因？

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老师，您好！全基因组选择，利用自己的SNP数据（芯片SNP）进行基因型数据处理，beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后，得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。

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plink做pca报错

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老师docker压缩包能不能发一下，给我的文件里面没有

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HISAT2比对时报错|sam文件为空白，summary文件为(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

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kneaddata做质控的时候，服务器卡死了，用trimmomatic+bowtie2分开跑是可以的吧

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16S课程 03.asv_taxonomy

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16S课程 启动镜像（DockerDesktop）

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运行自己的数据绘制Upset图，这个报错是什么原因呢？

  • halo 2025-08-27 18:27
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16S课程 02.feature_table #16S 分析 deblur

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16S课程 03.asv_taxonomy

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老师，我做基因家族基因结构变异信息时，只有8条结果，这个结果还能继续往下做么？我又做了一个家族，有70多条变异信息，这个结果怎么样

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mcmctree运行很长时间

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老师，您好。在转录组学和代谢组学做联合分析时，必须要在同一通路下分析，还是相关通路都能分析，如转录组的植物激素信号转导（ko04075）和代谢组的植物激素合成(ko01070)能联合分析吗