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请问如果系统是windows server 2016版的话安装docker的话应该选择哪个版本呢

  • Nier 2025-12-12 16:07
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让公司给构建好的图形泛基因组，只有vcf格式文件，要拿它作为参考去基于二代重测序的数据call snp,需要将vcf 文件转化成啥格式呢？转化后用什么软件去call snp 呢？

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组学大讲堂的一个T2T组装培训课，在进行组装前先除去了和细胞器DNA高度相关的reads。但是我看现在大部分的文章没有特别处理细胞器的DNA，是在组装的过程中已经被除掉了吗？

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新上的空间转录组课程可以用于分析华大基因测的数据吗

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5 你好，我和你遇到了同样的问题，请问你现在这个问题解决了吗？

  • 2025-12-18 16:04
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泛基因家族分析-SV和表达量

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空间转录组saw count 运行到register时报错

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泛基因家族分析数据准备里面，运行命令保留最长转录本结果都会报错，说是找不到文件，但文件存在在data目录下， ./.gff3.gz does not exist，Please verify the input file name/path

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在KEGG通路中（植物激素信号转导），我只关注这个通路下的几个基因（赤霉素有关），那么他的gene.ratio和p_value也要变化吗，以及如何计算

  • 2025-11-25 09:06
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Tassel表型文件和基因组文件样本量不一样

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单细胞测序cellranger分析

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可能是路径出了问题，无法找到脚本，请问老师

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老师请问一下我在做hic挂载练习的时候运行到使用bwa的aln和sampe进行比对，这里问什么不运用mem这个功能进行比对呢

  • Nier 2025-10-17 16:36
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泛基因家族分析的数据准备的里面有一个加载全局变量env.sh,请问这个有什么作用？里面改没改这个Ref=B73为自己的物种有什么区别呢，修改了要不要加这个基因组的具体路径？

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在全基因组选择育种课程中，所有需要预测的样本（在 pred_ID.csv 中列出的ID），必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中，是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分？我需要预测新的群体，那这 pred_ID.csv文件该如何编写？

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你好老师为什么这里无法启动镜像

  • Nier 2025-12-27 18:23
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重测序过滤

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叶绿体比较基因组分析你好，我组装好的Fasta文件是一条一条的，课程里重复序列和多态性分析用的示例文件是总all.fasta,我需要怎么能整合起来，一条条好像也分析不成

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泛基因家族分析PAV_gene.list中基因数量，少于gene.pep.fa中序列的数目

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在PAV分析绘制热图的时候，运行R脚本出现如下错误，请问怎么解决？这个aplot安装包安装也一直安装不了