IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

IF=5|干眼症微生物多样性分析案例解析

最新研究证实,人体体表与体内共生着约100000亿个细菌、病毒及真菌等微生物,这些微生物的数量是人体自身细胞的10倍,它们独特编码的基因数量比人体自身的基因组多100倍,有1000到1150种细菌定植在肠道内,其中约160种是人体肠道的优势菌群。已有研究表明人体微生物与很多人类疾病息息相关。如肠道微生物分泌的神经递质,可调节肠道神经系统中的神经信号,导致帕金森病、抑郁症、自闭症及阿尔茨海默病等神经精神系统疾病。过度肥胖、糖尿病、系统性自身免疫性疾病及肿瘤等全身性疾病与肠道微生物菌群紊乱也有着十分紧密的联系。因此,研究人体微生物与人类疾病的相互关系成为人体微生物组研究的热点。正因如此,发表疾病相关的微生物组研究的文章也相对容易,今天给大家介绍一篇眼部疾病相关的5分文章,一起来学习一下吧!


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文章介绍

干眼症是自身免疫性疾病最常见的眼部特征,例如类风湿性关节炎 (RA)、系统性红斑狼疮 (SLE)、系统性硬化症和特发性干燥综合征 (SS)。这些自身免疫性疾病中干眼症的比例分别为 71.4%、36%、64.7%和 35%,分别。因此,自身免疫性疾病相关的干眼症是最重要的干眼症类型之一。与没有自身免疫性疾病的干眼患者相比,患有自身免疫性疾病的干眼患者眼表细胞损伤更严重,治疗难度更大。但是,这种差异的具体机制尚不清楚,另外,自身免疫性疾病是否会影响干眼的眼部微生物群尚不清楚。本研究的目的是探索患有和不患有自身免疫性疾病的干眼症中微生物群多样性和组成的差异。

取样方法

结膜囊下穹窿的拭子样本,取自无自身免疫性疾病的干眼患者(n = 49,干眼组)和患有自身免疫疾病的患者(n = 38,免疫干眼组)。用 16S rRNA 扩增子测序分析从拭子中分离的细菌 DNA。

结果简介

  1. α 多样性分析显示干眼和非干眼组受试者之间没有显着差异。与干眼组相比,干眼组的微生物组成明显不同。attachments-2022-02-TFVc8cH36209e335d8ad9.png

    2. 棒状杆菌属和佩洛单胞菌属的丰度变化,可以将干眼组受试者与干眼组受试者区分开来,AUC值达到 0.73 (95% CI = 0.62-0.84)。对于相同的细菌,两组的微生物丰度与眼表参数之间的相关性不同。


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    3. 微生物群落的功能两组之间存在差异。


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    总结:研究表明,有免疫疾病干眼组和无免疫疾病干眼组受试者眼部微生物组的组成和功能发生了变化,这表明潜在的发病机制是不同的。本文只测了两个分组,分别38和49份样本,就发了5分的文章,真是小投入大产出。

    参考文献:

    Qi Y, Wan Y, Li T, et al. Comparison of the Ocular Microbiomes of Dry Eye Patients With and Without Autoimmune Disease. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:716867. Published 2021 Sep 22. doi:10.3389/fcimb.2021.716867



  • 发表于 2022-02-14 13:07
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  • 分类:宏基因组

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