如何看懂微生物多样性分析当中三元相图ternary

三元相图查看说明

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  • 发布于 2018-06-13 13:07
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排序分析PCA、PCoA、CA、NMDS、RDA、CCA等区别与联系

降维排序分析方法包括:PCA、PCOA、CA、DCA、NMDS、RDA、CCA等等还有很多,理解他们的区别与联系才能熟练运用。

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  • 发布于 2018-05-29 13:00
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如何正确选择差异统计检验

对于科学问题,我们常常要找到差异,需要用到统计学检验,但是那么多统计学检验我该如何选择呢?

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  • 发布于 2018-05-24 17:51
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beta多样性中的距离矩阵总结

距离矩阵差别:jaccard bray-curtis 欧式距离 unifrac(weighted/unweigted)

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  • 发布于 2018-05-24 13:20
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微生物多样性分析之Bray curtis距离

 Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的主要基于OTUs的计数统计比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离包含的信息完全不一样相比于jaccard距...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:21
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微生物组间差异分析之LEfSe

lefse分析

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  • 发布于 2018-05-17 21:52
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微生物PCA分析和PCOA分析差别

PCA pcoa分析取舍

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-15 18:01
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MEGAN 分类学树状图 饼图说明

MEGAN分类柱状图解释

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-11 16:06
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OTU互作网络分析用MENA

MENA,一个可以利用OTU数据进行在线分子生态网络分析的网站,帮你搞定OTU互作网络图。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 21:19
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做微生物研究必懂的OTU table相关知识

微生物多样性分析中最基础、最重要的文件为OTU table,因此理解OTU table的含义和来路,对微生物多样性分析至关重要。本文介绍OTU table是怎么样一步一步得来的,及其注意事项。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:53
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微生物多样性alpha分析看不明白?看这里!

在微生物多样性分析的报告中主要包括五个部分:Alpha多样性分析、Beta多样性分析、物种组成分析、进化关系分析、差异分析,本文主要介绍Alpha多样性分析的结果。

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  • 发布于 2018-04-20 19:31
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Beta多样性分析

Beta多样性用于不同生态系统之间多样性的比较,也就是样品间的差异,详细介绍beta多样性结果内容及意义。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:25
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你不知道的微生物互作分析方法

16s测序数据除了进行常规的Alpha多样性分析,Beta多样性分析,以及PCA分析之外,还能做什么?

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-20 19:07
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