微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
微生物多样性扩增子（16S/18S/ITS）课程更新v2.0
广受好评的微生物扩增子分析课程已经更新v2.0，主要更新内容如下：
- 使用最流行的工具qiime2分析扩增子数据
- 使用主流的基于降噪的方法生成feature-table，同时也兼容基于聚类的方法生成OTU table（内存限制）
- 物种分类注释数据库更新到最新，silva(138)，greengene(2022_10),ITS(ver9)
- 物种差异比较新增数十种方法：ALDEx2 , DESeq2, edgeR ,limma.voom,metagenomeSeq,LinDA,Maaslin2,Lefser,t.test,ANNOVA等方法，总有一款适合你的数据
- 扩增子分析镜像版本升级，使用一个镜像完成所有分析:omicsclass/ampliseq:v2.0
- qiime2 更新到最新版本(2023.7)
- 其他软件更新到最新版本（faprotax，Lefse，PICRUSt2等）
- 绘图脚本美化更新升级等
镜像更新v2.0:
docker pull omicsclass/ampliseq:v2.0
docker run -it -v ~/ampliseq:/work omicsclass/ampliseq:v2.0
视频课程链接如下：
https://bdtcd.xet.tech/s/qZRiF
- 发表于 2023-12-05 13:25
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- 分类：宏基因组
