omicsgene
TCGA生存分析课程的数据准备
请问，在TCGA差异分析课程中的差异表达矩阵是用ensembleID表示lncrna，而TCGA生存分析的表达矩阵是用lncrna的gene symbol，请问是怎么转换的，用ensemble官网转换之后，代码总报错，请问该怎么...
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- 盘子被夹子夹着
- 发布于 2018-09-20 15:00
- 阅读 ( 3096 )
盘子被夹子夹着
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 采用CD-HIT合并转录本
CD-HIT合并pacbio转录本
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- microRNA
- 发布于 2018-09-19 10:41
- 阅读 ( 6375 )
microRNA
Pacbio三代无参全长转录组(Iso-Seq) 的转录本合并策略
Pacbio三代无参全长转录组(IsoSeq3) 的转录本合并策略
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- microRNA
- 发布于 2018-09-19 10:06
- 阅读 ( 6438 )
miRWalk: 一个预测人类miRNA靶基因的网站
miRWalk: 一个预测人类miRNA靶基因的网站
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- microRNA
- 发布于 2018-09-18 11:48
- 阅读 ( 16922 )
LncBase: 一个预测人类miRNA 靶向lncRNA的网站
LncBase: 一个预测人类miRNA 靶向lncRNA的网站
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- microRNA
- 发布于 2018-09-18 11:42
- 阅读 ( 18697 )
红橙子
MeV 绘制热图过程如何对图片颜色做出修改
利用MeV绘制热图，方法可参考： http://www.omicsclass.com/article/263 其中对热图颜色模式进行修改主要在Display中完成，具体可以通过Display-->Color Scheme 进行（见下图）： Gree...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-14 15:57
- 阅读 ( 11243 )
Daitoue
Perl 中的特殊变量 $&, $`,$'
Perl 中的特殊变量 $&, $`,$' 用在模式匹配中 $& 用来存放匹配中的值 $` 用来存放匹配中之前所有字符 $' 用来存放匹配中之后所有字符 如： #!/usr/bin/perl -wmy $a =...
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- 安生水
- 发布于 2018-09-14 15:05
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安生水
TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析
TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析
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- microRNA
- 发布于 2018-09-14 14:22
- 阅读 ( 6409 )
meme分析motif结果中，自己序列上的motif序列信息查看
motif分析结果查看，基因上motif的序列信息，
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- omicsgene
- 发布于 2018-09-14 11:53
- 阅读 ( 34862 )
Excel图表保存成高清图片
Excel是一款非常强大的电子表格软件，而其图表工具，基本上每一个科研狗都用它画过图。在Excel内，作为矢量图的数据图表可以随意放大缩小，但但是是……作为Excel数据图表没有办法直接保存，更不...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-14 09:43
- 阅读 ( 23061 )
直方图---ggplot2（每组内添加对应的count 或者density文本标签）
利用ggplot2绘制直方图，基于几何对象geom_histogram()函数 geom_histogram(mapping = NULL, data = NULL, stat = "bin", position = "stack", ..., binwidth = NULL, bins = NULL, na.rm =...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-14 00:08
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ggplot2图例位置legend.position调整
ggplot2绘图过程种，控制图例在图中的位置利用theme(legend.position）参数 该参数对应的设置如下： legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-13 18:19
- 阅读 ( 38036 )
生信老顽童
