Mapman对表达数据进行聚类分析

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物代谢通路注释+基因表达可视...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-27 10:17
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JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-27 10:14
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R进行超几何分布计算

超几何分布的R实现

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-27 09:55
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利用WGCNA分析提升转录组测序文章档次

下面就给大家介绍两篇利用WGCNA分析基因共表达网络来提升文章档次。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-27 09:51
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提取指定基因的fasta序列

简便好用的序列提取的perl脚本

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-27 09:31
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用cmd来启用软件,这样桌面就简约了

1、第一步先将软件添加到路径中 2、第二步,win+r,输入cmd,此处以QQ为例 下次直接打开这个就行了,不用点其他的了 3、在win+r界面可以经常使用小软件,如,calc等等。。。。

python 学习2

python学习2

Python 学习(一)

1:、数值类型 整型、浮点型、布尔型、复数型 整型:1;2 浮点型:a=1.1;b=2.3 布尔型:True;False 复数型:e=1+1j 2、查看类型 令a=1 dir(a) 3、查看数据类型 4、a+=1等于a=a+1 a-=1...

linux的简单命令(二)

linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...

GoMapman-几种模式植物蛋白、代谢物、sRNA关于Mapman注释查询

推荐一个Mapman 本体查询的网站:GoMapman(http://www.gomapman.org/) 网站主要涉及了蛋白、代谢物以及sRNA在Mapman注释通路的查询。通过完整可以浏览具体的通路上可能会涉及那些基因,也可...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-26 13:24
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做韦恩图?自己搞定!

韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-26 11:08
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欢迎加入组学大讲堂问答社区

组学大讲堂问答社区,欢迎您加入 www.omicsclass.com

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-25 17:51
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rmvnorm函数生成随机矩阵

借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-25 11:42
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利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
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18年上半年,利用GEO/TCGA数据库发表文章超过1000+

2018年最新利用TCGA/GEO数据库挖掘文章列表

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-07-23 11:42
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perl中的正则表达式

perl中的正则表达式

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-20 15:00
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GFF3格式说明

GFF3格式说明

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 12:01
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Muscle 进行多序列比对

MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:53
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blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
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TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-20 10:58
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