全部 - 文章 - 第91页 - 组学大讲堂问答社区

pheatmap返回的结果解释（获得新的排序信息）

pheatmap是一个热图绘制的R包，全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap()，对应的数据则是一个数值矩阵，譬如基于如下的矩阵10X6： > mat CK-WT-1 CK-WT-2 ...

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Daitoue
发布于 2018-10-19 14:23
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多基因组基因水平共线性分析

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安生水
发布于 2018-10-19 13:39
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blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明（blast+ m6格式）

blast 结果说明

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omicsgene
发布于 2018-10-19 12:06
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blastall 参数详细说明

用blastall进行序列比对，详细参数说明

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omicsgene
发布于 2018-10-19 11:49
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bedtools求交集

bedtools求交集其用法： bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式，至少三列，分别...

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安生水
发布于 2018-10-19 11:30
阅读 ( 7706 )

多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

蛋白质分析，经常要分析蛋白质的保守结构域，通常要展示多序列比对结果才能说明不同序列间的保守性；看到别人分析的蛋白保守结构域都有一个漂亮的多序列比对结果；今天我们就来介绍绘制这种氨基酸比对图：

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omicsgene
发布于 2018-10-19 10:07
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多基因间共线性及局部基因水平的共线性

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安生水
发布于 2018-10-19 09:24
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采用traceback 进行R语言报错信息的调试

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microRNA
发布于 2018-10-18 20:54
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hmmsearch搜索蛋白保守结构域结果说明

hmmearch搜索结果说明

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omicsgene
发布于 2018-10-18 14:37
阅读 ( 23868 )

eclipse下搭建shell脚本编辑器--安装开发shell的eclipse插件shelled

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omicsgene
发布于 2018-10-18 13:22
阅读 ( 3470 )

NCBI上下载参考基因组信息

有时候，常用的基因组收录数据库网站上没有收录我们要研究的物种的基因组，比如ensembl，JGI上都没有，这时候我们可以考虑一下NCBI上收录的基因组；但是NCBI上收录的不常见的物种注释信息往往不是很完整，而且基因和染色体编号都会重新命名，用起来很麻烦；所以除非迫不得已，一般不建议从NCBI上下载参考基因组;