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运行Linux版本ProteoWizard中的chainsaw工具时报错

chainsaw工具，用于预测蛋白序列的酶切结果运行命令： chainsaw test.fasta 报错： locale::facet::_S_create_c_locale name not valid 解决：在当前环境中运行命令 export LC_ALL=C;...

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rzx
发布于 2023-09-27 15:02
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使用MCscan进行多物种共线性分析与绘图

在基因家族分析中，有时候我们会想要知道我们所关注的基因家族在不同物种基因组间的同源性情况，或者只是简单的想要了解物种间染色体的进化关系，这时候就需要进行物种间全基因组的共线性分析，然后根据共线性分析结果进行可视化。今天我们就来教大家使用一款常用的共线性分析和可视化软件——MCscan，进行多物种的基因组共线性绘图。

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每天学习一点点
发布于 2023-09-26 17:40
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EndHiC绘制HIC热图

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安生水
发布于 2023-09-26 17:25
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小尺度的种群历史分析——∂a∂i原理解析

种群历史分析中我们最为关注的主要有以下三个方面：1.分化时间与顺序；2.种群大小；3.分化后群体之间的基因交流情况。通常我们会使用PSMC去进行种群历史变化的研究，但其更适用于百万年的大尺度分析，而2万年以内的变化则很难真实体现。什么软件既能回答以上三个方面的问题，又不受时间尺度的局限呢？那就是∂a∂i！

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Ti Amo
发布于 2023-09-26 11:21
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密钥生成教程

Secure Shell (SSH) 是一个允许两台电脑之间通过安全的连接进行数据交换的网络协议，本文主要涉及如何生成密钥。

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Ti Amo
发布于 2023-09-22 16:33
阅读 ( 924 )

一抗二抗怎么选？义翘神州来教你

一抗是能和对应抗原特异性结合的免疫球蛋白，种类包括单克隆抗体和多克隆抗体。检测任何靶蛋白都有多种抗体可供选择，一抗选择主要考虑以下几点因素：

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xiaoqin2023
发布于 2023-09-22 11:33
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蛋白纯化的原理、操作及注意事项有哪些？

不同的重组蛋白具有不同的氨基酸序列和空间结构，导致其物理、化学和生物学特性存在差异。我们也可以根据目标蛋白与其他蛋白和裂解液的性质差异设计合理的蛋白纯化方案。

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xiaoqin2023
发布于 2023-09-21 14:59
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GATK报错：Could not find walker with name: VariantFiltration

在使用GATK软件的时候出现报错命令行： /share/work/biosoft/java/latest/bin/java -XX:ParallelGCThreads=5 -Xmx50g -Djava.io.tmpdir=/share/nas5/renzx/project/zx-20230821-248_noref_...

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rzx
发布于 2023-09-21 14:57
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常用的抗体亲和力成熟技术有哪些？

根据体内抗体亲和力成熟原理，在体外抗体亲和力成熟过程中，选择突变区域以及如何引入突变是一个关键问题，目前的突变策略主要分为三大类，随机突变、置换和定向突变。

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xiaoqin2023
发布于 2023-09-21 14:57
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谷胱甘肽-S-转移酶(GST)是一个由211个氨基酸组成的大小为26kDa序列，它是另一种广泛使用的可提高靶蛋白的溶解度亲和标签。GST标签与固定化的谷胱甘肽具有亲和力，常用于原核表达。它可以与一个蛋白的N端或C端融合。谷胱甘肽亲和是一种有效的一步纯化GST(谷胱甘肽S-转移酶)标签蛋白的方法。GST可作为一种可溶性蛋白在大肠杆菌细胞质中大量表达，并具有完全的酶活性。此外，许多在大肠杆菌中表达时不溶的真核蛋白，在表达为GST标签蛋白时被证明至少部分可溶。

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xiaoqin2023
发布于 2023-09-21 13:27
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蛋白表达的影响因素及规避方法？

细胞作为生命的基本单位，必须利用其DNA中编码的信息来制造蛋白，因为蛋白对细胞结构至关重要，可以使细胞具有特定的形状和结构。根据中心法则，当DNA转录为RNA，RNA又被翻译成蛋白时，遗传信息则从DNA传递到RNA再到蛋白。那么影响蛋白表达的因素有哪些？又如何规避呢？

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xiaoqin2023
发布于 2023-09-21 13:23
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抗体生产的三个阶段-重组抗体的几种形式详解

重组抗体，也称为基因工程抗体，是指通过DNA重组技术将抗体相应的基因序列根据需要进行改造和重组，并构建在质粒上，再通过蛋白外源表达技术将构建好的质粒转染/转化入适合的宿主细胞表达获得的抗体。重组抗体很好的解决了动物源抗体引起的人体排斥反应，使得抗体实现人源化，使抗体的效能更为完善。

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xiaoqin2023
发布于 2023-09-21 13:19
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blastn使用方法及结果详解

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星莓
发布于 2023-09-20 15:19
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Seqkit，一款好用的蛋白质翻译软件

使用Seqkit进行核苷酸到蛋白质序列的转换

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每天学习一点点
发布于 2023-09-20 15:12
阅读 ( 5707 )

文献-子宫内膜癌-单细胞与空间转录组联合分享

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omicsgene
发布于 2023-09-19 21:58
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BaiduPCS-Go 使用小技巧

BaiduPCS-Go是用Go语言写的一个开源的小工具，可以以较快的速度完成网盘与文件之间的上传/下载，今天来分享一些好用的小功能。 1. 分享文件 # 仅分享三十天BaiduPCS-Go share s --period 30...

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Ti Amo
发布于 2023-09-19 17:58
阅读 ( 1635 )

Linux查看IP地址

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安生水
发布于 2023-09-19 16:25
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Screen：命令行下的多窗口管理器

简介 GNU Screen 是一个全屏窗口管理器，允许用户在一个物理终端上运行多个会话。每个会话都拥有独立的窗口，而窗口内则可以运行 shell 或其他程序。Screen 在远程工作、长时间运行的任务、多...

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xun
发布于 2023-09-19 10:56
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已知目标基因，如何进行局部共线性绘图？

在日常的生信分析中，通过一些组学分析策略我们能够得到与某一物种性状紧密关联的候选基因。在此情况下，如果我们想要对候选基因在其他物种中的同源基因进行查找，或者在染色体上对这些基因进行定位，那么就需要进行物种间基因座的局部共线性可视化(Microsynteny visualization)。今天我们就来教大家使用jcvi软件包中的子程序MCscan(Python version)进行物种间基因组的局部共线性绘图。