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用tassel软件输入的表型数据是质量性状时输入格式是和数量性状一样吗？用0和1进行赋值

  • Luck 2022-11-23 10:52
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您好，用tassel做gwas的时候质量性状的输入格式和质量形状的输入格式是否一样呢？

  • Luck 2022-11-17 16:32
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6 vcf文件中染色体名字更换

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LD为什么突然终止呢？自动就killed

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如何下载国际千人基因组计划完整vcf文件

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想问下用ADMIXTURE进行群体结构分析后，用课程提供代码可视化的时候，一直出现如下图的报错是怎么回事儿?输入文件的P,Q,nosex文件都检查了，没发现哪里的问题，之前其实也做过同样的分析，没有出现问题。这次只是数据量和个体数不同。应该怎么办？谢谢大家。

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想问下用ADMIXTURE进行群体结构分析后，用课程提供代码可视化的时候，一直出现如下图的报错是怎么回事儿？应该怎么办？谢谢大家。

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我想问下我在可视化的时候，部分窗口（点）展示不完全（只展示半个点）我应该怎么调整？点的大小调整过了 还是不行。需要用哪个参数进行调整呀？谢谢各位大佬！

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3 基因变异的VCF文件除了染色体部分外的其他变异数据如何过滤？

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kasp精细定位

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BSA结果，只有一个SNP

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老师如何利用gatk只对某几条染色体进行变异检测? 另外，如何使用gatk 设置线程数量？谢谢老师

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合并gvcf时程序终止

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请问下面图片中的提示是什么问题，谢谢

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设计SNP引物的命令无法运行，什么原因

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使用xpclr分析出现TypeError: ufunc 'true_divide' not supported for the input types'

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在用tassel对vcf进行sort时报的错，有哪位大佬知道怎么操作吗

  • yao 2022-06-07 15:46
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老师，我在用GATK的VariantFiltration过滤SNP的时候，遇到了报错java.lang.IllegalArgumentException: Inconsistent number of provided filter names and expressions: names=[PASS, my_snp_filter] exps=[QD < 2.0 || MQ < 40.0 || FS > 60.0]

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请问一下，我买了那个重测序分析的课程，是否可以用于寻找叶绿体基因组间的多态性位点

  • 2022-05-13 15:37
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annovar报错问题