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老师您好,我在fasttree构建系统发育树这一步,程序会被kill掉,看不到报错,前面的程序运行的都没有问题,唯一的一处报错出现在给vcf文件排序这里,但是这一步生成文件了 而且下一步转换格式也没有问题,这个该怎么解决呀
群体结构分析
Invincible
2022-04-04 16:09
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老师您好,群体结构分析自己的数据时,进行到文件格式转换那一步遇到了问题,报错写的是要将vcf文件正常排序,我自己在网上找到了相应的脚本,却不能正常运行,报错写的是不能生成JAVA虚拟机,我的脚本是不是有什么问题呀,这个应该怎么解决呀
群体结构分析
Invincible
2022-04-02 21:18
1
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大家好!我想问下Fst&pi进行选择性消除分析后,得到的fst-pi.A-vs-B.selected.region.txt文件里的信息是A群体受选择的窗口还是A和B总的受选择的窗口?我怎么可以得到A或者B群体受选择的窗口啊
2022-04-01 21:18
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2396
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我想问下基于Fst$pi进行选择性消除分析时,所关注的群体的右边受选择地区域如何找到呀?我看生成文件中是fst-pi.merged.all.txt,这个文件里地窗口内容应该是左右两边受选择的总的窗口
2022-04-01 19:52
1
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2013
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群体结构分析课程中文件格式转换这一步按着课程代码输入怎么也不成功,这是为什么呀
Invincible
2022-03-26 18:42
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2121
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GATK生成的vcf文件基因型有不是二倍体的(基因型只有一个值),该怎样理解和处理这些SNP?
vcf文件
七夕后21天
2022-03-22 15:32
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2244
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老师你好 我在用gatk合并gvcf文件的时候 系统提示有一个样本的gvcf文件某一行数据出现问题 这种情况应该怎么解决 是需要重新生成这个样本的gvcf文件吗?
GATK
St.Sky
2022-02-26 16:33
1
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gatk4 HaplotypeCaller报错
xinhj
2022-02-20 22:18
1
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老师,你讲的ssr引物设计,我按步奏为什么结果文件是空的
超光速fly
2022-02-18 15:46
1
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为什么ssr引物设计结果为空
超光速fly
2022-02-18 10:07
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2174
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HGMD数据库
HanKui
2022-01-22 00:10
1
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老师好,请问课程bsa分析中,mutmap能同时输入两个子代混池吗?
BSA
mutmap
菜兮
2021-12-28 13:17
1
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2560
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两个群体的snp-index怎么算?
snp-index
BSA;QTL-seq
2021-12-27 16:25
0
回答
2037
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5
诱变材料,且已自交 6 代,是否可用 QTL-seq 的方法来定位到基因?
《心向阳光&
2021-12-27 12:05
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gama 射线引起的大片段缺失
gama射线诱变
《心向阳光&
2021-12-22 13:19
1
回答
3478
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mutmap方法为什么必须要有回交过程?
mutmap
2021-12-22 10:53
0
回答
1581
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做关联分析时能否将颜色的RGB数值组转化成0到1或者-1到1的单个数值?求教!可付费!
短歌行向阳花
2021-12-21 08:42
0
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1806
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同一目下边的俩物种,基因组测序数据mapping率只有20%,这合理吗?
安静,安好
2021-12-10 15:08
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在01.phylo_tree ,文件格式转换这步,用您的docke或自安装 tassel-5 ,给vcf(23G)文件排序,排成tassel认可的序列,错误如下:Use -Xmx option in start_tassel.pl or start_tassel.batto increase heap size. Included with tassel standalone zip.
旱钮
2021-10-14 15:51
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如何添加内参物种构建进化树
构建进化树
Iron
2021-10-13 20:45
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