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重测序bwa之后排序报错

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群体遗传SNP获取

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100 SMC++进行种群历史分析时所用的VCF是否需要LD过滤

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我在call snp,使用GATK导入db,得到的结果中没有callset.json文件，我一共15条染色体，db文件夹里只有两个染色体的文件夹内容，麻烦老师解答

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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz

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5 请问在用SURVIVOR进行多样本SV合并出错

  • 2024-04-14 13:38
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有40个样本的基因型（重测序结果）、表型数据。可以做什么分析？

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变异结果过滤

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重测序circos运行失败

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CNV拷贝数变异

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如果是基于已知的两个遗传位点，用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪，处于这样的目的40个品种够吗，出于这样的目的的话对品种数量有要求吗？

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进行picard.jar MarkDuplicates REMOVE_DUPLICATES时，出现如下错误，烦请老师解答，谢谢！

1 解决

bwa比对

  • Jay 2024-03-04 18:37
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gvcf转换成vcf

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关于annover建库问题

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在学习基因组重测序过程中，执行变异结果统计与绘图展示的命令报错

  • 2024-03-26 11:13
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重测序cnv变异需要至少多少乘数据？

  • Iron 2024-03-13 21:47
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重测序比对

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如何从重测序的原始数据中提取某个基因序列？

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这里是啥情况