0 回答

老师，您好！我在用-SortGenotypeFilePlugin排序vcf文件时，得出来的文件比原始文件小很多。

  • QCJ 2023-08-08 16:56
1 回答

遗传图谱构建中群体SNP检测与开发

1 回答

SNP过滤问题

1 回答

5 老师好，我在跟着课程实操时，运行gatk call snp时候，使用源代码也报错了，我用的镜像是课程里的v1.1的版本还请老师帮忙看看，谢谢了！

1 回答

ANNOVAR变异注释报错：Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

2 回答

群体遗传课程admixture的问题

1 回答

请问在引物设计时出现了这样的问题怎么解决啊？

  • kid 2024-01-03 15:54
3 回答

请问老师为何绘制snp密度图报错？

0 回答

老师您好，请问一下GWAS筛选植物NPK高效因子前需要做什么准备工作

1 回答

变异结果过滤，gatk VariantFiltration

1 回答

vcftools --vcf GT_AGCT_Liujingyan.vcf --max-missing 0.5 --maf 0.05 --remove-indels -- min-alleles 2 --max-alleles 2 --minDP 2 --minQ 20 --recode -- stdout >SNP_filter_maf0.05_miss0.5.vcf在这基础上增加杂合率，激昂杂合率设为80%或者60%，如果是自交系或纯合体，杂合率设为10%-20%怎么改

1 回答

重测序分析，bam去重复，建立索引后，call SNP之前的步骤

1 回答

3 进行bam文件排序时报错 killed

1 回答

PopLDdecay总是显示command option error

  • 231 2023-09-27 15:49
1 回答

重测序annovar注释

1 回答

群体结构中的最佳K值

  • 231 2023-10-13 09:52
1 回答

请问老师，使用annovar进行注释出现报错，如下：Error: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

1 回答

老师您好，我在做变异结果质控，过滤二vcftils.p1代码输入无误但是结果总是显示command not found ，生成文件为空是怎么回事？

  • WHR 2023-10-27 00:18
1 回答

变异注释

2 回答

重测序中GATK无法运行