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老师好，请问一下为什么annovar注释完下图所示第1列与最后两列的突变信息不一致啊，网上很多教程我看也有这个问题似乎，所以比如第一行核苷酸到底是什么突变成什么了呢？谢谢！

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得到INDEL,在做注释的时候报错。

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老师们好，在生成gvcf文件合并vcf文件时，出现这种警告信息，请问是什么原因，如何处理啊？

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老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时，因为样本过多（二三百个样本），运行成功的单个样本运行了24+个小时，尝试了采用ParaFly工具多任务并行，并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&（一个gatk.g.sh对应一个样本），但是都是在十几分钟后终止进程了，查看了其中一个gatk.g.sh.o文件，文件内容如下，烦请老师帮忙提出问题及解决方法，非常感谢

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老师，问题比较复杂，麻烦您看一下详细的问题描述，小麦基因组

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PSMC

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单倍型分析报错

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老师您好，使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊，是后台有参考数据库吗？

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20 群体遗传构建进化树格式转换报错

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在对bam文件进行排序时，因为参考基因组太长，出现这两个报错，会影响后续分析嘛

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群体结构分析时，执行代码报错

1 解决

使用重测序的var_density.R脚本没有按照染色体正确排序，这个怎么解决？

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变异结果统计与绘图时，最后一步出现Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 17 did not have 34 elements的问题，查看文件发现并没有缺失的部分，怎么解决

1 解决

老师，您好，请问如何展示出染色体上某个基因的，或者说某个位点附近的核苷酸多样性值，FST值或者tajimas值。

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老师，请教一下，重测序时对bam文件排序出现问题，提示Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: Invalid lookback distance found.怎么解决呀

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SRA数据下载

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老师您好，我在参考基因组建立索引时，系统报错说有1700个基因区域没有ORF，但是我的参考基因组和注释文件都是从文献链接里下载的，不知是否会影响我的后续关于群体进化的分析呢？

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cnvpytor 不运行

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10 gvcf文件转vcf文件，创建索引时一直失败，请问

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genome