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并行运行

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老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件，这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个

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重测序分析

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xpclr报错AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

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用GATK call 变异的时候，分染色体还是很慢，能不能增加线程或别的改进的方法。

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重测序

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并行运行

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重测序 htop 查看服务器使用

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重测序分析

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sed -i 'ls/Marker/chr\tpos/' glm_pvale.txt sed: -e 表达式 #1, 字符 2: 命令后含有多余的字符↵

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利用GATK 分染色体call 变异时出现错误

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ggtree.r进化树问题

  • BJFU 2024-12-30 08:43
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老师您好，在参考基因组比对时出错。

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合并GVCF文件

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测序文件中提取基因序列

  • bomm 2025-03-09 22:57
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如何下载别人的重测序数据

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老师，我在做dadi分析的时候，发现没有代码里显示的easySFS.py的脚本，给的文件里也没有，就一直报错

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重测序

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5 gatk变异检测

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对原始序列进行去接头，删除低质量的reads