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重测序文件中的data data 文件打不开

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老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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重测序

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老师，在第三步vcf文件过滤时，得到的all.clean.vcf文件太小了，宽松设置调整数值后，依旧很小，怎么办啊，有没有其他的方法，可以让最后的数据大一些啊

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10 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

  • YYJ 2024-12-30 20:45
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重测序

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重测序

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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重测序

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老师 就是我也买啦那个群体遗传的那个课程 我看啦一下 就是您课程上讲解的是下载参考基因组是拟南芥 我是做越峰杜鹃的 然后我重测序的也是 我的参考基因组是不是我自己组装出来越峰杜鹃的那个基因组啊 还是其他的呀 这里我没懂

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重测序

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重测序

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重测序

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重测序

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重测序

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群体遗传分析数据过滤

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重测问题

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重测序

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老师您好，下载镜像失败显示这个该怎么解决？

  • BJFU 2024-11-26 16:44