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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 16:27
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在基因家族分析时，保留编码蛋白基因命令时出现 bash :agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl : command not found

  • Lu 2024-03-18 15:52
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LDBlock绘制局部曼哈顿图的时候，我想加入目标区段多个环境SNP检测到的P值，请问数据格式是什么谢谢

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老师，我分析的物种是6倍体，参数需要变动嘛？

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老师，我不知道 circos片段重复基因共线性分析图哪里出错了，画不出来

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重测序cnv变异需要至少多少乘数据？

  • Iron 2024-03-13 21:47
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nextpolish报错

  • 荣 2024-03-06 23:19
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R语言“had non-zero exit status”安装报错

  • 2024-03-05 10:28
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有40个样本的基因型（重测序结果）、表型数据。可以做什么分析？

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30 533个品种先根据盐浓度下发芽率，初步在盐胁迫下挑选120个具有不同发芽时间的品种（不发芽的品种忽略，会导致出现重复表型），然后进一步进行详细表型分析（增加测量性状，如根长、芽长、光谱性状），然后做GWAS关联。

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如果是基于已知的两个遗传位点，用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪，处于这样的目的40个品种够吗，出于这样的目的的话对品种数量有要求吗？

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survey图

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我想问一下从公司获得测序数据如果是以下的cleandata，我们是否从章节2课时6看起就可以了呢，是否向需要进一步质控？

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docker

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如何实现把InDel标记变为SNP格式？

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进行picard SortSam 出现问题怎么处理？谢谢！

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转录组分析流程详细流程？

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被鉴定过的基因家族

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https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件，进行GWAS分析，下载哪几个啊

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https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件，进行GWAS分析，下载哪几个啊