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putty打开没反应

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共线性分析，我看文献有说共线区块，我可以通过什么命令来计数？

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我的fasta文件是由scaffold组成的，不是直接的A01和C01之类的，然后我现在用现有的文件以Gapit方式跑曼哈顿图时报错，该怎么调整

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终端没反应

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基因家族分析环境变量

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共线性分析，绘图报错。看不懂，请问是啥意思？

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共线性分析，请问layout内容问题在哪里？

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共线性分析，最后一步出不来pdf。看不懂提示。

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共线性分析出现如下报错，但是还是有结果。而且也能出图。这是怎么回事呢

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不同物种之间的共线性分析，出现问题，望解答、谢谢

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单细胞测序，想要以选定的基因绘制2.2这样的图，应该怎么做

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单细胞测序生成的图片基因名字字体比较小，需要修改什么参数

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GWAS分析绘制QQ图时，Observed值与Expected值相差较大

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iqtree模型选择问题

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blsatp，我想拿发表文献的基因ID的蛋白序列和我自己搜出来的序列（$species.gene.pep.fasta）比对。我先是把这两个序列放在一起。然后再建库比对。出现问题。怎么办？后来我在那个gene.pepe.fasta中选择几个序列和发表文献的序列放在一起建库比对就能行。原因是什么？我

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ParaAT批量比对，该怎么执行+X？

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时，输入这段代码后，报错，显示颜色数量不足，怎么解决

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docker

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Rscript $scriptdir/gapit_gwas.r -i /work/hapmap.txt.gz -t /work/Sugar.txt -m GLM -n hd.GLM.GWAS.Results 就是我执行完这个命令，一直在这个界面，等一个多小时都没反应，hapmap文件大小260M，是还在运行，还是哪里错了