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10 您好，请问SNPT软件失效了

  • cc 11小时前
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基于图形泛基因组文件call取sv的时候，运行命令nohup vg call new_index.giraffe.gbz -r new_index.snarls -k D23.pack -a -A -t 30 -s D23 > D23.vcf 2>call.o &，显示done，但生成的vcf文件里面没有变异位点，只有个头，如截图中所示。这种问题怎么解决呢？

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EMMAX进行GWAS分析时候出现问题

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泛基因家族做完PAV分析后，发现有的物种没有任何一个基因

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你好老师为什么这里无法启动镜像

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在基因组注释部分有一条命令RepeatMaskerLib=/share/work/biosoft/RepeatMasker/RepeatMasker/Libraries/RepeatMaskerLib.h5用来指定RepeatMaskerLib所在位置，那这里如果是要在自己的电脑上跑的话这里路径变量应该在哪呢

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泛基因组基因家族_PAV分析，核心和可变基因富集分析问题

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空间转录组saw count 运行到register时报错

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5 你好，我和你遇到了同样的问题，请问你现在这个问题解决了吗？

  • 2025-12-18 16:04
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5 你好，请问你当时提出的那个问题解决了吗，我现在也是卡在这一步了，求指教

  • 2025-12-18 16:02
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单倍型分析

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请问如果系统是windows server 2016版的话安装docker的话应该选择哪个版本呢

  • Nier 2025-12-12 16:07
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全基因组选择运行Bayesian_train.r时报错

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无法登录PuTTY

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让公司给构建好的图形泛基因组，只有vcf格式文件，要拿它作为参考去基于二代重测序的数据call snp,需要将vcf 文件转化成啥格式呢？转化后用什么软件去call snp 呢？

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重测序var_density.R脚本报错

  • BJFU 2025-12-05 16:42
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重测序var_density.R脚本报错

  • BJFU 2025-12-05 16:39
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提供感兴趣基因进行分支分析时，出现Error in simple_vs_index(x, rlang::eval_tidy(args[[1]]), na_ok) : Unknown vertex selected报错

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SV与家族基因的保守结构域分析

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轨迹分析出现killed报错