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从NCBI上下载的序列在进行序列多态性分析和构建系统发育时，是否需要先人工校正？

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购买了课程有赠送联系使用的服务器吗？

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三代转录组做基因注释的课程

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100 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时，即聚类生成OTU-denovo时老是报错，查看类似问题后，升级了运行内存为70g，同时将教程内的30多个样本减成2个样本，FASTQ格式还有qimme格式检查都正确，依旧报错，报错内容如下：Segmentation fault

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您好，我做全长转录组，我安装的软件isoseq3没有polish这个功能？请问我要安装isoseq3的哪个版本？

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请问三倍体重测序数据可否用于2n配子形成机制的研究

  • 2023-05-31 11:03
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15 您好，三代全长转录组无参测序，昆虫前后2次取样，第2次雄昆虫测的数据量是第一次雌昆虫的2倍，最后得到转录本是第1次的2倍。这个结果怎么解释啊？

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5 使用allhic挂载染色体时，长度排序前十的超长contig只有一个挂载到group中，如何将这些未挂载的超长contig也绘制到heatmap图中

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按着课程做，用的也是组学的数据，KEGG富集分析，只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

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老师，我这里有一个物种的3条基因，序列的相似度都在60%以上，smart预测都是有相同的结构域，他们是属于不同的序列，还是发生了基因复制？如何进行判断，不知道从哪里入手。

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10 尊敬的老师，在按照咱们课程进行选择消除分析 fst pi ROD时，可以正常输出pi.wild，为什么画图的时候图为空的，是不是数据有问题，我的数据是真菌的，fai文件只有1kb，

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关于动植物基因组组装课程中关于重复序列注释的问题

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老师，根据遗传进化课程做LD，测试文件和我的数据输出的文件都是空的，这是什么问题呢？

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10 尊敬的老师！！恳请您在百忙中帮忙解答！根据群体遗传进化课程我构建进化树，显示如下错误。我的VCF文件通过如下命令进行排序，。排序后VCF文件缩小了很多，是对的吗？是不是我的vcf文件有问题，但是我PCA和STRUCTURE都是可以分析的，急需亲爱的老师们解答！！！

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老师，我想问一下，一个基因因为可变剪切不同，出现不同蛋白序列，我在确定基因家族成员时取舍的标准是什么

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无法链接到docker守护进程

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在初次docker运行程序时发现问题

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3 MCScanX分析时 transcript_id与基因组蛋白序列ID不一致，不能获得对应的.pep文件

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做基因家族分析时，用MCScan做共线性分析，跟着教程走没有发现有串联重复的基因，这种结果正常吗？

  • 2023-05-24 13:51
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用MCScan做共线性分析时，准备allmRNAID.txt文件，发现有些转录本定位在了contig上，这些定位在contig上的转录本需要算进去吗？

  • 2023-05-24 00:55