运行这个脚本seurat_DimPlot.r时出现报错

查看批次效应运行这个脚本时Rscript $scripts/seurat_DimPlot.r \

 -i benihoppe_flower_sct/benihoppe_flower_sct.qs \

   --reduction umap  --label  --group.by SampleID \

 -p SampleID  --pt.size 0.1  出现以下报错

[ reached 'max' / getOption("max.print") -- omitted 1 rows ]

Error in file(filename, "r", encoding = encoding) : 

  cannot open the connection

Calls: source -> file

In addition: Warning message:

In file(filename, "r", encoding = encoding) :

  cannot open file '/work/benihoppe_flower/scripts/palette_colors.R': No such file or directory

Execution halted出现palette_colors.R这个脚本不存在


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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  • gz_li 提出于 3小时前

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