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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 18:42
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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 16:27
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在基因家族分析时，保留编码蛋白基因命令时出现 bash :agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl : command not found

  • Lu 2024-03-18 15:52
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10 在无参转录组中，如果之前有人鉴定过某一物种的转录组并为相关基因命名了，后人要沿用吗

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一个家族基因隐马尔科夫模型

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LDBlock绘制局部曼哈顿图的时候，我想加入目标区段多个环境SNP检测到的P值，请问数据格式是什么谢谢

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老师，我分析的物种是6倍体，参数需要变动嘛？

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5 在使用Gepard时出现了这样的图，与教程中的不一样，请问是哪里除了问题，如何改正？

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单倍型分析中最后一步失败，麻烦老师

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老师好 plink分析pca 一直报错

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老师换了新的config3.txt，但是只出来了svg格式的图，没有png格式的图，而且出来的图不对，没有连线，空空如也。

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在circos绘图时，最后一步不出图，显示出错误

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非模式物种建库进行GO和KEGG富集分析

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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz

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老师，我不知道 circos片段重复基因共线性分析图哪里出错了，画不出来

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重测序cnv变异需要至少多少乘数据？

  • Iron 2024-03-13 21:47
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gvcf转换成vcf

1 解决

在用cmscan进行ncrna注释的时候出现了segmentation fault （core dumped）

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合并g.vcf

  • Jay 2024-03-12 19:22
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水稻LD的衰减距离如何计算？

  • kid 2024-03-12 17:18