我做有参转录组数据分析,一共有30个样,每个样有3个重复。在做比对这一步时,我发现30个样中,有两个样,它们各有一个重复的比对率只有50%,而其他的样比对率均有80%以上,请问这样会对实验结果有影响吗?

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1 个回答

红橙子
比对率低一般是由于污染、样品测序质量、样品与参考基因组亲缘关系等原因, 你这个样品应该是有问题的,最好先找出问题,然后再考虑是否剔除。
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  • 红橙子 提出于 2019-09-20 10:56

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