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做有参转录组分析,在进行基因表达定量的时候,出现如下警告,请问老师这是什么原因呀
有参分析
scau_bioinfo
2019-12-15 11:59
2
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5634
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hisat2建立index时的问题
hisat2
RNA-seq
章鱼哥吹笛子
2019-12-13 18:20
1
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用ClustVis绘制热图出现的状况
heatmap
ClustVis
凤凤
2019-12-13 18:12
1
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老师,只有FPKM的话,能用什么R包做差异分析啊?
RNA-seq
DEG
小朱大夫
2019-12-11 21:22
1
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做有参转录组分析,在进行基因表达定量的时候,出现如下问题,请问老师这是什么原因呀
scau_bioinfo
2019-12-10 15:17
1
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如何查找青蒿素合成的相关基因
朝阳
2019-12-10 10:35
2
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3961
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老师,你好。在做有参转录组分析,准备的文件有基因组注释文件gtf,cds,pep(其中cds,pep都是fasta格式的序列文件),命令如下。其中第一个截图是参考pep文件,比对率为0,;第二个结果是参考cds文件,比对率为57.81%,比较低,这是哪里出了问题吗。另外所以准备的文件应该是cds文件而不是pep文件是吗
hisat2
scau_bioinfo
2019-12-07 17:37
1
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2042
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老师,您好,我是在做有参转录组分析。在对基因组构建HISAT index时,所产生的splicesites.tsv,exons.tsv文件大小为0,但是并没有报错,请问这是什么原因呀,命令如下
HISAT
scau_bioinfo
2019-12-03 10:42
1
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6307
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想请教老师热图里的Row-z-score和Column-z-score分别是如何计算。我的数据热图用Row-z-score画完结果显示与实际数值不大对,选column好像才对。
heatmap
hqhk0308
2019-11-27 17:57
2
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3610
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RNA-seq分析建立基因组index遇到问题
RNA-seq
没有角的龙
2019-11-27 09:20
0
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2847
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老师,请问下非编码RNA(miRNA)的启动子如何获得呀?
miRNA
酒七
2019-11-19 21:10
0
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各位大神,为什么我在BioMart里提交GO号之后一直下载不了基因的启动子序列?一直显示网络错误,我已经买了服务器,谷歌,youtube都能上,帮帮忙
lucky girl
2019-11-17 19:37
1
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2229
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转录组问题
RNA-seq
雪儿
2019-11-08 10:51
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回答
2247
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转录组问题
RNA-seq
雪儿
2019-11-06 21:09
1
回答
2883
浏览
5
用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”
hisat2
落井不忘下石人
2019-11-03 18:48
0
回答
3025
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大家好,请问箱线图怎么分析
2019-11-01 15:05
0
回答
1797
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十折交叉验证是啥意思
王晓庆
2019-10-29 16:03
1
回答
1413
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GFF文件解释
2019-10-25 11:06
1
回答
3216
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老师您好,我有个问题想请教您,就是以您看的文献来说,您觉得有转录因子调控CDPK激酶的文献,就是说转录因子可以和CDPK激酶的启动子结合的例子吗?因为我用某个CDPK酵母双杂交筛到了一个转录因子,现在不确定到底是这个转录因子结合了CDPK的启动子,还是这个CDPK激酶对这个转录因子磷酸化,对于它们的上下游关系我还不是太明白,是不是用CDPK筛到的转录因子就说明了什么关系呢它们之间
小不点
2019-10-23 20:01
1
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请问如何根据已有转录组预测转录因子的靶基因?
2019-10-23 18:21
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