10 用gffread将gtf转化为fasta报错

命令行: gffread -w classcode.fa -g Genome.fa classcode.gtf

报错:Error: sequence lines in a FASTA record must have the same length!

输入的参考基因组:attachments-2020-07-tCbfR5i45f16a2cdab98f.png


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你说得是我组学大讲堂里面转录组课程里面得问题吗:二代测序转录组数据自主分析

我们课程中没有用到这个命令。

你这个错误可能是基因组文件格式问题你再检查一下;

保证序列行每一行长度相等试试;

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