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查找不同分组之间差异表达基因报错：没有DESeq2包

  • Iron 2020-10-14 10:14
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合并不同样品表达定量结果all_gene_count.tsv文件出问题

  • Iron 2020-10-13 00:19
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您好 我使用GEO芯片数据课程的 download R文件下载 GSE80751和GPL17692时出现这个提示，运行后面的代码就会报错如图2，请问问题在哪里，怎么解决，谢谢！

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请问GEO芯片数据挖掘课程只适用于芯片数据，还是geo上转录组测序数据都可以用

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参考基因组比对，sam为空

  • Iron 2020-09-29 21:27
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老师，我在做完串联重复以后，发现成对基因互相比较的相似性、比对上的长度、还有其他值不一样是怎么回事（只有一对基因对是一样的）？不一样的怎么选择呢？

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建立基因组索引时gene_length文件出问题

  • Iron 2020-09-25 23:13
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10 请问有没有有关一个“科”物种转录组的汇总研究

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你好，之前看您想用转录组比对基因组数据，不知道是否有结果和方法

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基因组索引

  • Iron 2020-09-20 14:18
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FPKM值的理解困惑：双端测序时，一个fragements的两端都测序，结果是有两个reads，那在计算FPKM定义时，说Fragment的最终数目是Reads的1到2倍之间，不应该是reads是fragements的1-2两倍吗，

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差异基因用p-vaule筛选可以吗？

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GO和KEGG富集分析keytype选择？

  • 荣 2020-09-14 21:41
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安装AI软件的时候出现错误代码16请问该如何解决

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用组学大讲堂RNAseq Docker镜像时报错 “bash: RUN: command not found”

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您好，请问怎样做转录组数据分析？

  • 2020-09-13 18:05
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3 转录组送样细胞固定

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6 关于mapman使用过程的问题

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老师，mcscan_seqid里面的逗号改了也还是float divirision by zero 报错。两个bed文件和CDS文件里的染色体ID都对应的。实在找不出来原因!

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老师，我从ncbi上下载月季的基因组测序数据时找不到cds文件，但找到了其他的gff文件，RNA文件，DNA文件，蛋白序列文件 请问有什么方法可以从它们当中提取cds序列吗