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做韦恩图？自己搞定！

韦恩图又称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具，简单易学！

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-26 11:08
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利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域，应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search，而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域，对研究基因的功能是非常重要的，因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域！

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
  • 阅读 ( 66405 )

Muscle 进行多序列比对

MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件，在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候，大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:53
  • 阅读 ( 7983 )

blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast，其比对结果一般都用m8格式（即参数是 -m 8，blast+是 -outfmt 6），但是结果文件中是没有表头的，这里来写一下。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
  • 阅读 ( 18254 )

植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

你可以对基因进行功能注释，分析其功能分类以及相关的通路信息，你也能分析基因的表达谱数据，但是你知道如何将二者进行结合吗？在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据？有一个工具可以做...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-20 09:18
  • 阅读 ( 13216 )

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop，用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少，甚至事半功倍。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-19 11:47
  • 阅读 ( 7982 )

java 安装以及环境变量配置

配置JAVA环境，运行java程序

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 22:38
  • 阅读 ( 11371 )

在线版fimo程序做转录因子结合位点预测

meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点，这里介绍一下他的在线版用法。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 14:27
  • 阅读 ( 6520 )

python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

手把手教你多个基因组共线性作图。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-12 17:14
  • 阅读 ( 24782 )

GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

在线GO富集分析

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-11 10:38
  • 阅读 ( 15024 )

MCScanX 在biolinux上安装及使用

MCScan安装与共线性分析练习

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 13:58
  • 阅读 ( 23985 )

blast报错

在刚开始按官网教程（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/）学习使用blast时，经常会遇到程序报错

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 15:00
  • 阅读 ( 10372 )

BLAST+使用方法

BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件，有NCBI提供

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:36
  • 阅读 ( 6131 )

dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

之前在做dcaps标记，开始只找到网站版的软件，后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:21
  • 阅读 ( 5453 )

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿，除了文好当然还要“颜好”！在这个看脸的世界，为了给文章加分，各位老师学生也是做足功课了！但是不会编程敲代码？——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
  • 阅读 ( 12655 )

DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:39
  • 阅读 ( 3283 )

你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后，会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件！

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 09:33
  • 阅读 ( 10773 )

endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

endnote 文献插入出现大括号，不自动更新解决办法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-27 17:53
  • 阅读 ( 32017 )

搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-25 15:45
  • 阅读 ( 4600 )

MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错，所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 14:21
  • 阅读 ( 32945 )