一键搞定批量序列提取TBtools！
用基因ID提取其序列很简单，ctrl+F找到ID对应的序列，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？ 这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtoo...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 19:08
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landy
分分钟教你绘制基因结构图！GSDS
今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server，简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构，清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 18:59
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两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！
使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。 第一步：选择合适的树形 使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...
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- landy
- 发布于 2018-04-22 18:38
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ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看
参考基因组下载，Ensembl，NCBI，JGI等网站下载使用，可视化浏览,基因查看与下载等；
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:59
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omicsgene
从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据
用迅雷替代官方的prefetch批量下载SRA测序数据，更快更稳定！
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:37
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sci-hub文献下载网站
学术界的“盗版女王”，哈萨克斯坦研究生兼女黑客亚历山德拉·埃尔巴克彦。文末附可用链接，再也不用担心下载不到文章了。
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:26
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phytozome植物基因组下载网站
今天主要介绍一下Phytozome网站基因组如何下载，通过blast查询多个物种中得同源基因，以及根据基因相关功能结构域等批量下载相关基因的CDS，PEP等序列信息；
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:21
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安生水
轻松搞定fasta索引文件、序列提取
fasta是常用的序列存储格式，很多软件（如GATK、IGV等）在导入序列以及进行快速查找时通常需要建立索引文件。本文介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 11:05
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怎么做一张好看的分类学树状图
在做微生物多样性分析时，经常会接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn，用它生成的图会更好看哦！
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:55
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正选择分析之 Site Models
作为常用的正选择分析方法，计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:39
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鉴定组装植物病毒——系统详尽的植物病毒学！
一本系统详尽讲述植物病毒的书-Plant Virology Protocols（文末有获取方式），堪称病毒学研究里程碑式巨制。主要内容是如何鉴定组装植物病毒！
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- 红橙子
- 发布于 2018-04-21 22:56
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红橙子
生信老顽童
