R语言中%>% 作用
libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
绘制全基因组甲基化图谱
当使用循环跑R函数的时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候,需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包,专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入,以生成一系列图表,可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。
在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量,分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素,例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等,这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的,但是会影响基因表达的因素),需要进行预先处理。
R markdwon 代码块选项说明:
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的,用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb (transcript database)包,有两种构建方式,一...
libpcre2-8.so.0是PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)库的一个版本,通常用于支持正则表达式。
R 安装包:configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见,因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中,当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...
R语言对重复的行名进行重命名操作
在进行韦恩图绘制的时候出现报错: 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list,要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B",...
例如在R语言中,rnorm()函数为随机生成多个随机数,每次使用都会得到不同的结果 > rnorm(3) [1] -2.0235077 0.3552526 0.6239982 > rnorm(3) [1] 1.101044 -1.297740 1.717356 如...
1.join函数;2.创建新的顺序变量;3.inner_join函数