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fastp过滤宏基因组序列

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老师，我做泛基因家族鉴定时，06.SV_analysis最后得到的All.final.sv.out基因结构变异信息只有一条，请问哪里可能有问题

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老师您好，进行比较基因组分析时候，在第一步数据处理，保留编码蛋白基因，及最长转录本时，出现报错，这个对后续分析有影响嘛

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老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

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老师您好，做比较基因组分析时，单拷贝同源基因的这个文件是空的Orthogroups_SingleCopyOrthologues，并且orthofinder文件夹也是空的，是什么原因造成的

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老师您好，我做比较基因组时，orthofinder2运行时出现报错，这是什么原因？该如何解决。请老师解答

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老师，您好！请问做全基因组选择（GS选择）之前，训练集和预测集的划分，有没有代码可以按照特定比例，随机快速实现材料的划分，并生成文件？（比如20%个体作为训练集，80%个体作为预测集；40%个体作为训练集，60%个体作为预测集；60%个体作为训练集，40%个体作为预测集；80%个体作为训练集，20%个体作为预测集，等等）

  • 2025-08-08 16:14
1 解决

3 map bwa出错

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老师您好，我在运行OrthoFinder2时，出现下面报错，请老师解答

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有参转录组数据分析，样品和基因组比对效率只有零点几，这是为什么？

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5 Orthofinder报错出现ZeroDivisionError: float division by zero

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老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

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我输入docker run那条指令后，出现了以下报错，输入docker search omicsclass也出现报错。

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泛基因家族分析核心基因的确定

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泛基因家族分析绘制kaks>1频率分布的热图

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群体结构clean.vcf.gz转换成phy文件失败

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为什么启动镜像时总是出现这样的报错啊老师

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GATK 分染色体CALL变异之后怎样合并

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合并CNV结果失败

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泛基因家族分析进化树构建