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3 老师，您好，我们是做忙果基因家族分析的，用的是linux（用拟南芥的数据我们都能做出结果），但忙果注释文件gff总是报错，对我们学农的来说，对脚本真是一窍不通啊，根本不知道该怎么修改，老师叫我们把gff文件改成拟南芥的格式，用linux做，我们的基因id，mRNAid，蛋白id都是不一样的，我们想都改成与基因id一致的，我该怎么改啊，老师可以帮忙看看文件吗

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做亚细胞定位，请问老师cyto_nucl这个说的是哪个位置；后面的数字又如何理解；cyto是说细胞质还是细胞骨架，因为开头字母都一样

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最新qiime2教程16S注释报错

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pfam 网站没有办法检查基因的结构域就用CDD和SMART的并集吗

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用Tassel转vcf为hapmap格式文件

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基因组重测序数据分析实战课程中的index.sh运行报错，显示没有对应的pl

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下载gene family镜像总失败

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老师您好，请问蛋白序列有多个基因结构域，做系统发育树以哪个结构域为准呢

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老师您好，有多个结构域时，做系统发育树以哪个结构域为主呢？

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No file mirdeep_runs/ tmp/precursors.fa_stack found

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PSMC分析作图时物种的繁殖速度参数如何设置

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老师你好，我在再次搜索新建物种特异hmm模型时，显示segmentation fault，请问是怎么回事呢

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老师，麻烦您再帮忙看看下载镜像v2.0时出现了pulling fs layer，但是查找镜像时又显示有了2.0这个镜像，我下载成功了吗

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老师您好，我根据您的方法从GFF信息，从基因组里提取基因的蛋白序列和 cds序列，但是显示command not found，请您看看是怎么回事呢？上面写的代码要在分析镜像2.0中进行，但是课程给我们的只有v1.0.1，不知道是不是这个原因呢？

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motif展示

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Get "https://theme-kit-access.shopifyapps.com/cli/meta.json": dial tcp 185.146.173.20:443: connectex: A connection attempt...

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请问在获取基因与mRNA的对应关系这一步，会出现提示说mRNA没有相对应的gene id 呢，可是文件中有gene id 呢，如图所示，而且输出的mRNAgeneID.txt里也没有转录本信息

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10 非模式物种eggnog 批量注释，输出的pep.fa没有内容

  • 2023-04-05 15:06
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非模式物种eggnog 批量注释，输出的pep.fa没有内容

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查看基因组文件里面有哪些信息时，除了CHr还有NSCAFA等其他的，是为什么呢